RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGL2O15211 777 aa32.48■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXB7P09629 217 aa32.48■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SETDB2Q96T68 719 aa32.48■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNA3P22001 575 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF652Q9Y2D9 606 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCER2I3L3R5 266 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C8orf58Q8NAV2 365 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL16Q14005 1332 aa32.45■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.44■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF6Q6ZMV9 814 aa32.44■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHPF2Q9P2E5 772 aa32.44■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.43■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRNA5P30532 468 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC24Q8N4L8 307 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.41■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COPS6Q7L5N1 327 aa32.4■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR63Q8IWG1 891 aa32.4■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPYL6Q8N831 410 aa32.4■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRIN3BO60391 1043 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNBD1Q8NA66 436 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP10DQ9P241 1426 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIM2Q9P1W9 311 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCS1LQ9Y276 419 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP98P52948 1817 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM177BA6PVY3 158 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YY1P25490 414 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MIER1Q8N108 512 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF521Q96K83 1311 aa32.32■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPTP24298 496 aa32.32■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.32■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ST5P78524 1137 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HYPKQ9NX55 129 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPHP1O15259 732 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H0YIN7 160 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE6BP35913 854 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUSD4Q5VX71 490 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC30Q5VVM6 783 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLBD2Q8NHP8 589 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCC12Q96J65 1359 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NTSR2O95665 410 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA2Q08379 1002 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCIRG1Q13488 830 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERFEQ4G0M1 354 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NYXQ9GZU5 481 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHD4Q14839 1912 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRGNP10124 158 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PARP10Q53GL7 1025 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa32.22■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTLL6Q8N841 843 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHMP4AQ9BY43 222 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.21■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VAMP4O75379 141 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRP10Q86W26 655 aa32.2■■■□□ 2.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.18■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STYK1Q6J9G0 422 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MASTLQ96GX5 879 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ISCA1Q9BUE6 129 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF428Q96B54 188 aa32.15■■■□□ 2.74
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