RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-209ENST00000415046 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-209ENST00000415046 ADH6P28332 368 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-209ENST00000415046 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-209ENST00000415046 STRN4Q9NRL3 753 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-209ENST00000415046 KLF15Q9UIH9 416 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-209ENST00000415046 SFI1A8K8P3 1242 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 AMPD1P23109 780 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 RRAGCQ9HB90 399 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 MARK1Q9P0L2 795 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 BTBD6Q96KE9 485 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 C21orf2O43822 256 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 ITGB2P05107 769 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 RASA1P20936 1047 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 DGKGP49619 791 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 COL8A1P27658 744 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 SEC13P55735 322 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 CHSY3Q70JA7 882 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PIK3R2O00459 728 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 GNB5O14775 395 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 PTK7Q13308 1070 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 MSTNO14793 375 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 MDFIQ99750 246 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-209ENST00000415046 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 KRBA1A5PL33 1030 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 FAM196BA6NMK8 535 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 SIN3BO75182 1162 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 PROCP04070 461 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 TYRO3Q06418 890 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 GRIN2CQ14957 1233 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L15C9J2P7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L10C9JJH3 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L12C9JPN9 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L11C9JVI0 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L21D6R901 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L18D6R9N7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L22D6RA61 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L19D6RCP7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L20D6RJB6 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 USP17L24Q0WX57 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 SYT9Q86SS6 491 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ELOA3Q8NG57 546 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 SUSD3Q96L08 255 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 BRD7Q9NPI1 651 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 KCNQ4P56696 695 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 DPYDQ12882 1025 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 CEP63Q96MT8 703 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 SLC30A3Q99726 388 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 SPEM2Q0P670 501 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 HIF1AQ16665 826 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 IGFBP4P22692 258 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 TNFRSF25Q93038 417 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 ARXQ96QS3 562 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-209ENST00000415046 HINFPQ9BQA5 517 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.3 ms