RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.2■■□□□ 1.63
SPRN-201ENST00000414069 STAP2Q9UGK3 403 aa25.19■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 LRRC37A3O60309 1634 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 RASEFQ8IZ41 740 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 GRM8O00222 908 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 KAZALD1Q96I82 304 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 RAB11FIP3O75154 756 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 IGKV5-2P06315 115 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CNTROBQ8N137 903 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CYP27B1O15528 508 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 PDIA6Q15084 440 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 PHKG2P15735 406 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 NUCB2P80303 420 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 HOXB7P09629 217 aa25.15■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.14■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
SPRN-201ENST00000414069 CHGBP05060 677 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 PTH1RQ03431 593 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 STRN4Q9NRL3 753 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 HYPKQ9NX55 129 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 KCNJ4P48050 445 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 FAM227BQ96M60 508 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 SASH1O94885 1247 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 LINS1Q8NG48 757 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 RGPD5Q99666 1765 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 SGSM2O43147 1006 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 CABP4P57796 275 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 MEGF6O75095 1541 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.08■■□□□ 1.61
SPRN-201ENST00000414069 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.08■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 ALDH1L1O75891 902 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 GPT2Q8TD30 523 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 HSPA4P34932 840 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 AK2P54819 239 aa25.06■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 LARGE1O95461 756 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 UQCRHP07919 91 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 GCKRQ14397 625 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 FSD1Q9BTV5 496 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 RAD50Q92878 1312 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 A0A087WZG4 1122 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 RNF214Q8ND24 703 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 A1BGP04217 495 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 A0A0G2JS52 829 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 CACNA1FO60840 1977 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 NECAB1Q8N987 351 aa25.03■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 OFD1O75665 1012 aa25.02■■□□□ 1.6
SPRN-201ENST00000414069 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms