RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 PDIA6Q15084 440 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 CNBD1Q8NA66 436 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 ERBB4Q15303 1308 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF853P0CG23 659 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 BCORQ6W2J9 1755 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 IFT57Q9NWB7 429 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 GNAI1P63096 354 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 ST5P78524 1137 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 H0YIN7 160 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 GPTP24298 496 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 RGL2O15211 777 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 WWC1Q8IX03 1113 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 PDE6BP35913 854 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 COPS6Q7L5N1 327 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN2-204ENST00000404321 CHD4Q14839 1912 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 HOXB7P09629 217 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC27Q2M243 656 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 TTLL6Q8N841 843 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP10DQ9P241 1426 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 SUSD4Q5VX71 490 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 TSPYL6Q8N831 410 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ABCC12Q96J65 1359 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 SRGNP10124 158 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ERFEQ4G0M1 354 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF428Q96B54 188 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 NYXQ9GZU5 481 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-204ENST00000404321 RASSF7Q02833 373 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 MASTLQ96GX5 879 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 ADCY9O60503 1353 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 C21orf2O43822 256 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 STYK1Q6J9G0 422 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 HYPKQ9NX55 129 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 NTSR2O95665 410 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 IL16Q14005 1332 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 PARP10Q53GL7 1025 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 CNKSR1Q969H4 720 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 NUP98P52948 1817 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 NPR1P16066 1061 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 TCIRG1Q13488 830 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 RNF181Q9P0P0 153 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRN2-204ENST00000404321 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 WDR63Q8IWG1 891 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 NLRP10Q86W26 655 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.43■■□□□ 1.34
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