RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 FBXO41Q8TF61 875 aa25.44■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.43■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 GCC1Q96CN9 775 aa25.43■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.43■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 RREB1Q92766 1687 aa25.43■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.42■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 ATP6V1AP38606 617 aa25.42■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 MYD88Q99836 296 aa25.42■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 UTYO14607 1347 aa25.41■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.41■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 ITPK1Q13572 414 aa25.4■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 DCTPP1Q9H773 170 aa25.4■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HDDC3-202ENST00000394272 GRM8O00222 908 aa25.38■■□□□ 1.65
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HDDC3-202ENST00000394272 HMMRO75330 724 aa25.38■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 RGS3P49796 1198 aa25.38■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 NUCB1Q02818 461 aa25.38■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 GCKRQ14397 625 aa25.38■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.36■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.36■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.36■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 LY75O60449 1722 aa25.36■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.35■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.35■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 EP400Q96L91 3159 aa25.35■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.34■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.34■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.34■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.33■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.33■■□□□ 1.65
HDDC3-202ENST00000394272 SSH3Q8TE77 659 aa25.32■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 PDE4AP27815 886 aa25.32■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 MTX1Q13505 466 aa25.32■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.32■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 KAZALD1Q96I82 304 aa25.32■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 POLA2Q14181 598 aa25.31■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.31■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.31■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 SUCLG2Q96I99 432 aa25.31■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 NUP98P52948 1817 aa25.31■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 TCIRG1Q13488 830 aa25.3■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.3■■□□□ 1.64
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HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.3■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 COL15A1P39059 1388 aa25.3■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.3■■□□□ 1.64
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HDDC3-202ENST00000394272 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.29■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 CASP7P55210 303 aa25.28■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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HDDC3-202ENST00000394272 SRGAP3O43295 1099 aa25.28■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.27■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 A0A087WZG4 1122 aa25.27■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.27■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HDDC3-202ENST00000394272 H7C1W4 665 aa25.26■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 HLFQ16534 295 aa25.26■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 RXRBP28702 533 aa25.26■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 KCNQ4P56696 695 aa25.26■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.26■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 ARXQ96QS3 562 aa25.25■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.25■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.24■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.24■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.23■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HDDC3-202ENST00000394272 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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HDDC3-202ENST00000394272 TRIM37O94972 964 aa25.19■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 BACH2Q9BYV9 841 aa25.19■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 APBB1O00213 710 aa25.19■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 NLRP10Q86W26 655 aa25.19■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 C4BP0C0L5 1744 aa25.18■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 POTEAQ6S8J7 498 aa25.18■■□□□ 1.62
HDDC3-202ENST00000394272 RAB11FIP3O75154 756 aa25.17■■□□□ 1.62
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