RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393766.6

MSMO1-202, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSMO1, Length 1,789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-202ENST00000393766 SMC5Q8IY18 1101 aa20.61■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 ARXQ96QS3 562 aa20.61■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 HMMRO75330 724 aa20.6■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 GCC1Q96CN9 775 aa20.6■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.6■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 SBF2Q86WG5 1849 aa20.6■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.59■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.59■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 IGKV5-2P06315 115 aa20.59■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.59■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.58■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.58■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 FBXO41Q8TF61 875 aa20.58■□□□□ 0.89
MSMO1-202ENST00000393766 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.57■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.57■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 GRM8O00222 908 aa20.57■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 ITPK1Q13572 414 aa20.56■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.56■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.56■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 ATP8B2P98198 1209 aa20.55■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 GCKRQ14397 625 aa20.55■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.55■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.55■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 NUCB1Q02818 461 aa20.54■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 DCTPP1Q9H773 170 aa20.54■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.54■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.54■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.53■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.53■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 LNPKQ9C0E8 428 aa20.53■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 BCL11AQ9H165 835 aa20.52■□□□□ 0.88
MSMO1-202ENST00000393766 APBB1O00213 710 aa20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 UTYO14607 1347 aa20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 KCNQ4P56696 695 aa20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 SUCLG2Q96I99 432 aa20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 RREB1Q92766 1687 aa20.5■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 A0A087WZG4 1122 aa20.5■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 SRGAP3O43295 1099 aa20.5■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 PDE4AP27815 886 aa20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 RXRBP28702 533 aa20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 TCIRG1Q13488 830 aa20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.49■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.48■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 SSH3Q8TE77 659 aa20.48■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 LY75O60449 1722 aa20.48■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 NUP98P52948 1817 aa20.47■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.47■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 HLFQ16534 295 aa20.46■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 POLA2Q14181 598 aa20.46■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.46■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.46■□□□□ 0.87
MSMO1-202ENST00000393766 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 TRIM37O94972 964 aa20.45■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 KAZALD1Q96I82 304 aa20.45■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.44■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 GPTP24298 496 aa20.44■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 MTX1Q13505 466 aa20.44■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 COL15A1P39059 1388 aa20.44■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.43■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.43■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 H7C1W4 665 aa20.43■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.42■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.42■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 CASP7P55210 303 aa20.41■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 FAM161AQ3B820 660 aa20.41■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 GNPATO15228 680 aa20.39■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 RAB11FIP3O75154 756 aa20.39■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 CAMTA2O94983 1202 aa20.39■□□□□ 0.86
MSMO1-202ENST00000393766 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms