RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.43■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.42■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.42■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 HOXB7P09629 217 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 KCNA3P22001 575 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 CHRNA5P30532 468 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 SETDB2Q96T68 719 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.39■□□□□ 0.7
CSAG1-202ENST00000370287 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 RGL2O15211 777 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 NUP98P52948 1817 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.38■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 IL16Q14005 1332 aa19.37■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 TSPYL6Q8N831 410 aa19.37■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 CNBD1Q8NA66 436 aa19.37■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 ATP10DQ9P241 1426 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 FAM177BA6PVY3 158 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 CCER2I3L3R5 266 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 GRIN3BO60391 1043 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 YY1P25490 414 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 COPS6Q7L5N1 327 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 BCS1LQ9Y276 419 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 CHD4Q14839 1912 aa19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 GPTP24298 496 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 WDR63Q8IWG1 891 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-202ENST00000370287 NPHP1O15259 732 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ST5P78524 1137 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 PIM2Q9P1W9 311 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.32■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ABCC12Q96J65 1359 aa19.32■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF521Q96K83 1311 aa19.31■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.31■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 MIER1Q8N108 512 aa19.31■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 PDE6BP35913 854 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 SUSD4Q5VX71 490 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 HYPKQ9NX55 129 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 H0YIN7 160 aa19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 NTSR2O95665 410 aa19.28■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ERFEQ4G0M1 354 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 NYXQ9GZU5 481 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-202ENST00000370287 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.27■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 SRGNP10124 158 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 TCIRG1Q13488 830 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 TTLL6Q8N841 843 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF428Q96B54 188 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 PARP10Q53GL7 1025 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 NLRP10Q86W26 655 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 GOLGA2Q08379 1002 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 CACNA1SQ13698 1873 aa19.23■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 VAMP4O75379 141 aa19.23■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 STYK1Q6J9G0 422 aa19.23■□□□□ 0.67
CSAG1-202ENST00000370287 MASTLQ96GX5 879 aa19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.2 ms