RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.07■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 HOXB7P09629 217 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 TGFB2P61812 414 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC24Q8N4L8 307 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB3Q9H5J0 574 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CHPF2Q9P2E5 772 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CCER2I3L3R5 266 aa35.05■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 SETDB2Q96T68 719 aa35.04■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.04■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 KCNA3P22001 575 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CHRNA5P30532 468 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 PRR5LQ6MZQ0 368 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 TSPYL6Q8N831 410 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 IL16Q14005 1332 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 KIF6Q6ZMV9 814 aa35.02■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 ERVV-1B6SEH8 477 aa35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 RGL2O15211 777 aa35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 XAGE3Q8WTP9 111 aa35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 COPS6Q7L5N1 327 aa34.99■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 MIER1Q8N108 512 aa34.99■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
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TPGS1-201ENST00000359315 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.97■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 FAM177BA6PVY3 158 aa34.96■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 CNBD1Q8NA66 436 aa34.96■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 ATP10DQ9P241 1426 aa34.96■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 UBN2Q6ZU65 1347 aa34.95■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 GPTP24298 496 aa34.94■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF521Q96K83 1311 aa34.93■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 BCS1LQ9Y276 419 aa34.93■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 UTRNP46939 3433 aa34.92■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 NPHP1O15259 732 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN3BO60391 1043 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 C2CD5Q86YS7 1000 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.89■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.89■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 PIM2Q9P1W9 311 aa34.89■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 YY1P25490 414 aa34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 ST5P78524 1137 aa34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
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TPGS1-201ENST00000359315 SUSD4Q5VX71 490 aa34.87■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 HYPKQ9NX55 129 aa34.87■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC12Q96J65 1359 aa34.87■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 NUTM1Q86Y26 1132 aa34.86■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 NUP98P52948 1817 aa34.85■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.85■■■■□ 3.17
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TPGS1-201ENST00000359315 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 PDE6BP35913 854 aa34.83■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.83■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 H0YIN7 160 aa34.82■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 NTSR2O95665 410 aa34.82■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.82■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA2Q08379 1002 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ERFEQ4G0M1 354 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF428Q96B54 188 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 TCIRG1Q13488 830 aa34.8■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.79■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.78■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP34.78■■■■□ 3.16
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TPGS1-201ENST00000359315 SRGNP10124 158 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
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TPGS1-201ENST00000359315 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP10Q86W26 655 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 NYXQ9GZU5 481 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 TTLL6Q8N841 843 aa34.76■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 G2E3Q7L622 706 aa34.75■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.74■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa34.74■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 C3orf67Q6ZVT6 689 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 STK31Q9BXU1 1019 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 RIC3Q7Z5B4 369 aa34.72■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 SYNE4Q8N205 404 aa34.72■■■■□ 3.15
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