RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.83■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.83■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 HSPA1LP34931 641 aa22.83■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.83■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 KSR2Q6VAB6 950 aa22.82■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.82■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.82■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 PAPPAQ13219 1627 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 ATP8B2P98198 1209 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 COPS6Q7L5N1 327 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 HYPKQ9NX55 129 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 TNS2Q63HR2 1409 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 LRP6O75581 1613 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.81■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 PIGBQ92521 554 aa22.8■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.8■■□□□ 1.24
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SNX11-201ENST00000359238 DDB1Q16531 1140 aa22.8■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.8■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 ITGB4P16144 1822 aa22.79■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.79■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 NBPF26B4DH59 902 aa22.79■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 IGKV5-2P06315 115 aa22.79■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 NBPF14Q5TI25 921 aa22.79■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.79■■□□□ 1.24
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SNX11-201ENST00000359238 NBPF15Q8N660 670 aa22.79■■□□□ 1.24
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SNX11-201ENST00000359238 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.79■■□□□ 1.24
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SNX11-201ENST00000359238 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.78■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.77■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SNX11-201ENST00000359238 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.76■■□□□ 1.23
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SNX11-201ENST00000359238 KAZALD1Q96I82 304 aa22.76■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 HMMRO75330 724 aa22.76■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 A1BGP04217 495 aa22.76■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 PTMSP20962 102 aa22.76■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 A0A0G2JS52 829 aa22.75■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.75■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.75■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.74■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 SSH3Q8TE77 659 aa22.74■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 BARGINQ6ZT62 677 aa22.74■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 ATG3Q9NT62 314 aa22.74■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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SNX11-201ENST00000359238 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.73■■□□□ 1.23
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SNX11-201ENST00000359238 POLA2Q14181 598 aa22.73■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 TTC22Q5TAA0 569 aa22.73■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 GBP4Q96PP9 640 aa22.73■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.73■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 USP21Q9UK80 565 aa22.73■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 TERF1P54274 439 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 VPS72Q15906 364 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 LINS1Q8NG48 757 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 SNX21Q969T3 373 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 SUCLG2Q96I99 432 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 BCL9O00512 1426 aa22.72■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.71■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.71■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.71■■□□□ 1.23
SNX11-201ENST00000359238 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.7■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.7■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 OFD1O75665 1012 aa22.7■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 ALDH1L1O75891 902 aa22.7■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 GRM8O00222 908 aa22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SNX11-201ENST00000359238 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.69■■□□□ 1.22
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