RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 CCDC102BQ68D86 513 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TCF3P15923 654 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 RHOQP17081 205 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SMTNP53814 917 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 POU4F2Q12837 409 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 GNASQ5JWF2 1037 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 BCL11AQ9H165 835 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ZNF358Q9NW07 568 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 VEGFBP49765 207 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NBPF15Q8N660 670 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ABCC2Q92887 1545 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SIX5Q8N196 739 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ASXL2Q76L83 1435 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 KIF27Q86VH2 1401 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SLC35F4A4IF30 521 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 A6NJY4 79 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PPFIA3O75145 1194 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 VAMP1P23763 118 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PHKA2P46019 1235 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CUL7Q14999 1698 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SFI1A8K8P3 1242 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CDK2AP1O14519 115 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 ABL1P00519 1130 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 SEC13P55735 322 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 WDR44Q5JSH3 913 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCL20-201ENST00000358813 PRMT3O60678 531 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 MTFR1Q15390 333 aa8.33□□□□□ -1.08
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CCL20-201ENST00000358813 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TNS4Q8IZW8 715 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 FBXO41Q8TF61 875 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 H3BM21 787 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 M0R2N6 131 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ICMTO60725 284 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 WFS1O76024 890 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 DKK1O94907 266 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 C8orf37Q96NL8 207 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 CABP1Q9NZU7 370 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 UACAQ9BZF9 1416 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 H3BRB1 525 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ITGA6P23229 1130 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 SCNN1AP37088 669 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 PLA2G4AP47712 749 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 GLI2P10070 1586 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 MAPK1P28482 360 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 EPHA4P54764 986 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TBCELQ5QJ74 424 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 TREML4Q6UXN2 200 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 DRC1Q96MC2 740 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 HINFPQ9BQA5 517 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 USP3Q9Y6I4 520 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 A0A1B0GTH6 734 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 COL19A1Q14993 1142 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-201ENST00000358813 OCLNQ16625 522 aa8.29□□□□□ -1.08
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