RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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TM7SF3-201ENST00000343028 IGKV5-2P06315 115 aa23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3-201ENST00000343028 AOX1Q06278 1338 aa23.53■■□□□ 1.36
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TM7SF3-201ENST00000343028 SGSM2O43147 1006 aa23.53■■□□□ 1.36
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TM7SF3-201ENST00000343028 LINS1Q8NG48 757 aa23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3-201ENST00000343028 MYD88Q99836 296 aa23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3-201ENST00000343028 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3-201ENST00000343028 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.52■■□□□ 1.36
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TM7SF3-201ENST00000343028 SASH1O94885 1247 aa23.49■■□□□ 1.35
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TM7SF3-201ENST00000343028 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.48■■□□□ 1.35
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TM7SF3-201ENST00000343028 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3-201ENST00000343028 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3-201ENST00000343028 RAD50Q92878 1312 aa23.48■■□□□ 1.35
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TM7SF3-201ENST00000343028 GPT2Q8TD30 523 aa23.46■■□□□ 1.35
TM7SF3-201ENST00000343028 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.46■■□□□ 1.35
TM7SF3-201ENST00000343028 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.46■■□□□ 1.35
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TM7SF3-201ENST00000343028 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.44■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 AK2P54819 239 aa23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 CABP4P57796 275 aa23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.43■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.42■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 GPATCH3Q96I76 525 aa23.42■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.42■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF1AQ12756 1690 aa23.42■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.41■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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TM7SF3-201ENST00000343028 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 DCAF5Q96JK2 942 aa23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 BRD1O95696 1058 aa23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TM7SF3-201ENST00000343028 LARGE1O95461 756 aa23.39■■□□□ 1.33
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TM7SF3-201ENST00000343028 CHGBP05060 677 aa23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 UTYO14607 1347 aa23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.38■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 EVI5LQ96CN4 794 aa23.37■■□□□ 1.33
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