RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326407.10

ITM2C-201, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-201ENST00000326407 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ITM2C-201ENST00000326407 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ITM2C-201ENST00000326407 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ITM2C-201ENST00000326407 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.41■□□□□ 0.86
ITM2C-201ENST00000326407 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.4■□□□□ 0.86
ITM2C-201ENST00000326407 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ITM2C-201ENST00000326407 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
ITM2C-201ENST00000326407 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.39■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 EP400Q96L91 3159 aa20.38■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.38■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 MX1P20591 662 aa20.37■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.37■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 USP44Q9H0E7 712 aa20.37■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.37■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 ST18O60284 1047 aa20.37■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.37■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 CCDC125Q86Z20 511 aa20.36■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 DCAF5Q96JK2 942 aa20.36■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.35■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 SSFA2P28290 1259 aa20.35■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 BCL9O00512 1426 aa20.35■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 STAP2Q9UGK3 403 aa20.35■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 AOX1Q06278 1338 aa20.34■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 ANXA1P04083 346 aa20.34■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.34■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.33■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 SSH3Q8TE77 659 aa20.33■□□□□ 0.85
ITM2C-201ENST00000326407 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.33■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.33■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.32■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.32■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 NUCB2P80303 420 aa20.32■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 FAM182BQ5T319 152 aa20.32■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.32■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 MRE11P49959 708 aa20.31■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 ARXQ96QS3 562 aa20.31■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.3■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 RAB11FIP3O75154 756 aa20.3■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.3■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 POLA2Q14181 598 aa20.3■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 CHMLP26374 656 aa20.29■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 BEND3Q5T5X7 828 aa20.29■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 ADCY9O60503 1353 aa20.29■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.28■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.28■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 MCCP23508 829 aa20.28■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.28■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 C5P01031 1676 aa20.28■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.28■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.27■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 RILPL2Q969X0 211 aa20.27■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.27■□□□□ 0.84
ITM2C-201ENST00000326407 MRC1P22897 1456 aa20.27■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 PROSER3Q2NL68 480 aa20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 HYPKQ9NX55 129 aa20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 CABP4P57796 275 aa20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 ANAPC15P60006 121 aa20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 PANK2Q9BZ23 570 aa20.26■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 SLC39A6Q13433 755 aa20.25■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.25■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.25■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.25■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.25■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 SRGAP3O43295 1099 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 MCM2P49736 904 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 ZNF790Q6PG37 636 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 KSR2Q6VAB6 950 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 KCNQ2O43526 872 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 IL17RAQ96F46 866 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.24■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 ALDH1L1O75891 902 aa20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 NEK4P51957 841 aa20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 SBF2Q86WG5 1849 aa20.22■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.22■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 PIGBQ92521 554 aa20.22■□□□□ 0.83
ITM2C-201ENST00000326407 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms