RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 IL25Q9H293 177 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 UTYO14607 1347 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 GRM8O00222 908 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 KAZALD1Q96I82 304 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 SLAIN2Q9P270 581 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 GLI3P10071 1580 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 IGKV5-2P06315 115 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 CNTROBQ8N137 903 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 USP16Q9Y5T5 823 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 PKP1Q13835 747 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 ABCA3Q99758 1704 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 MCM2P49736 904 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 SUCLG2Q96I99 432 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 TMX3Q96JJ7 454 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 COPS6Q7L5N1 327 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 CABP4P57796 275 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS1-202ENST00000323081 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 SGSM2O43147 1006 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 IL17RAQ96F46 866 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 HSPA4P34932 840 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 MCTP1Q6DN14 999 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 MRE11P49959 708 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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SPNS1-202ENST00000323081 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.36■■□□□ 1.01
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SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.35■■□□□ 1.01
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SPNS1-202ENST00000323081 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 MYD88Q99836 296 aa21.35■■□□□ 1.01
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SPNS1-202ENST00000323081 PANK2Q9BZ23 570 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 CUL4AQ13619 759 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 SASH1O94885 1247 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-202ENST00000323081 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 SIL1Q9H173 461 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 PAPPAQ13219 1627 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 IL2RBP14784 551 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 EVI5LQ96CN4 794 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 NBPF26B4DH59 902 aa21.29■■□□□ 1
SPNS1-202ENST00000323081 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.29■■□□□ 1
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