RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.61■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 HOXC9P31274 260 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 EID1Q9Y6B2 187 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 GJB2P29033 226 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 TSC1Q92574 1164 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.6■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 MTMR6Q9Y217 621 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 AP5Z1O43299 807 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 NLRP6P59044 892 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 PTH1RQ03431 593 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.59■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 PLCB2Q00722 1185 aa23.58■■□□□ 1.37
PITX2-201ENST00000306732 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 TBX22Q9Y458 520 aa23.58■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 BEND3Q5T5X7 828 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 ST3GAL1Q11201 340 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 VPS53Q5VIR6 699 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 DIP2AQ14689 1571 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 ANXA1P04083 346 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 KCNA4P22459 653 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 ME3Q16798 604 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX2-201ENST00000306732 NECAB1Q8N987 351 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 FAM177BA6PVY3 158 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 KCNQ3O43525 872 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 KCNB2Q92953 911 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 LGR6Q9HBX8 967 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 ADCY9O60503 1353 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 SPC24Q8NBT2 197 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 NECTIN1Q15223 517 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 TTC6Q86TZ1 520 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CCDC192P0DO97 292 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 MTX1Q13505 466 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 KIF3AQ9Y496 699 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 FERMT3Q86UX7 667 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.45■■□□□ 1.35
PITX2-201ENST00000306732 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX2-201ENST00000306732 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PITX2-201ENST00000306732 ABTB2Q8N961 1025 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX2-201ENST00000306732 FAM227BQ96M60 508 aa23.45■■□□□ 1.34
PITX2-201ENST00000306732 HOXB7P09629 217 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX2-201ENST00000306732 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PITX2-201ENST00000306732 LIG1P18858 919 aa23.44■■□□□ 1.34
PITX2-201ENST00000306732 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms