RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.48■■□□□ 1.83
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SNRNP25-201ENST00000293861 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.47■■□□□ 1.83
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SNRNP25-201ENST00000293861 PIGBQ92521 554 aa26.47■■□□□ 1.83
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SNRNP25-201ENST00000293861 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.46■■□□□ 1.83
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SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF15Q8N660 670 aa26.46■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 MYD88Q99836 296 aa26.46■■□□□ 1.83
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SNRNP25-201ENST00000293861 GCKRQ14397 625 aa26.45■■□□□ 1.83
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SNRNP25-201ENST00000293861 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SNRNP25-201ENST00000293861 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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SNRNP25-201ENST00000293861 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.42■■□□□ 1.82
SNRNP25-201ENST00000293861 ATG3Q9NT62 314 aa26.42■■□□□ 1.82
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.42■■□□□ 1.82
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.42■■□□□ 1.82
SNRNP25-201ENST00000293861 SNX21Q969T3 373 aa26.41■■□□□ 1.82
SNRNP25-201ENST00000293861 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.41■■□□□ 1.82
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SNRNP25-201ENST00000293861 NBR1Q14596 966 aa26.41■■□□□ 1.82
SNRNP25-201ENST00000293861 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.41■■□□□ 1.82
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SNRNP25-201ENST00000293861 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
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SNRNP25-201ENST00000293861 REC8O95072 547 aa26.37■■□□□ 1.81
SNRNP25-201ENST00000293861 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.37■■□□□ 1.81
SNRNP25-201ENST00000293861 TJP1Q07157 1748 aa26.36■■□□□ 1.81
SNRNP25-201ENST00000293861 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.36■■□□□ 1.81
SNRNP25-201ENST00000293861 ERC2O15083 957 aa26.35■■□□□ 1.81
SNRNP25-201ENST00000293861 STARD3NLO95772 234 aa26.35■■□□□ 1.81
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SNRNP25-201ENST00000293861 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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SNRNP25-201ENST00000293861 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.35■■□□□ 1.81
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SNRNP25-201ENST00000293861 CASP7P55210 303 aa26.32■■□□□ 1.8
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A087WZG4 1122 aa26.31■■□□□ 1.8
SNRNP25-201ENST00000293861 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.31■■□□□ 1.8
SNRNP25-201ENST00000293861 CHMLP26374 656 aa26.31■■□□□ 1.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.3■■□□□ 1.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.29■■□□□ 1.8
SNRNP25-201ENST00000293861 H7C1W4 665 aa26.29■■□□□ 1.8
SNRNP25-201ENST00000293861 SASH1O94885 1247 aa26.29■■□□□ 1.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 RABEP1Q15276 862 aa26.28■■□□□ 1.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.28■■□□□ 1.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.26■■□□□ 1.8
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SNRNP25-201ENST00000293861 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
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