RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 HOXB7P09629 217 aa24.66■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 MRS2Q9HD23 443 aa24.66■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.65■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.65■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 IFT57Q9NWB7 429 aa24.64■■□□□ 1.54
MALSU1-201ENST00000287543 GNAI1P63096 354 aa24.63■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 HLFQ16534 295 aa24.63■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC184Q52MB2 194 aa24.63■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 SCN7AQ01118 1682 aa24.62■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.62■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 NYXQ9GZU5 481 aa24.62■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 CHD4Q14839 1912 aa24.61■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF853P0CG23 659 aa24.61■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 PDIA6Q15084 440 aa24.61■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.61■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.61■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 CNKSR1Q969H4 720 aa24.6■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.6■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 ADCY9O60503 1353 aa24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC27Q2M243 656 aa24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 STYK1Q6J9G0 422 aa24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 MASTLQ96GX5 879 aa24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 MBIPQ9NS73 344 aa24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.58■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.58■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 ATP10DQ9P241 1426 aa24.58■■□□□ 1.53
MALSU1-201ENST00000287543 SRGNP10124 158 aa24.57■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.57■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 PARP10Q53GL7 1025 aa24.56■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.56■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.56■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.56■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 KRT24Q2M2I5 525 aa24.55■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.55■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 COPS6Q7L5N1 327 aa24.55■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.55■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.55■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 NECTIN2Q92692 538 aa24.55■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 FAM177BA6PVY3 158 aa24.54■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 NPR1P16066 1061 aa24.54■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 PROSER3Q2NL68 480 aa24.54■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 SOGA3Q5TF21 947 aa24.54■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.53■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 HYPKQ9NX55 129 aa24.53■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 ANXA1P04083 346 aa24.52■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 GPTP24298 496 aa24.52■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.52■■□□□ 1.52
MALSU1-201ENST00000287543 BCORQ6W2J9 1755 aa24.52■■□□□ 1.52
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MALSU1-201ENST00000287543 WWC1Q8IX03 1113 aa24.51■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 LMNB1P20700 586 aa24.5■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 ALDH1B1P30837 517 aa24.5■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 SUSD4Q5VX71 490 aa24.5■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 RNF181Q9P0P0 153 aa24.5■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 IL16Q14005 1332 aa24.5■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 C21orf2O43822 256 aa24.49■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.49■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 C1QTNF8P60827 252 aa24.48■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 TCIRG1Q13488 830 aa24.48■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.48■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.48■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.48■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 ERFEQ4G0M1 354 aa24.47■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.47■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 NTSR2O95665 410 aa24.46■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 CRY2Q49AN0 593 aa24.46■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.46■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.45■■□□□ 1.51
MALSU1-201ENST00000287543 WDR63Q8IWG1 891 aa24.45■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 NFKBIEO00221 500 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 RASSF7Q02833 373 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 NLRP3Q96P20 1036 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.44■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC93Q567U6 631 aa24.43■■□□□ 1.5
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