RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 TSPOAP1O95153 1857 aa25.17■■□□□ 1.62
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ODC1-201ENST00000234111 KRT85P78386 507 aa25.16■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.16■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 HYPKQ9NX55 129 aa25.16■■□□□ 1.62
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ODC1-201ENST00000234111 NEMFO60524 1076 aa25.08■■□□□ 1.6
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ODC1-201ENST00000234111 AOX1Q06278 1338 aa25.07■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 DIP2BQ9P265 1576 aa25.07■■□□□ 1.6
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ODC1-201ENST00000234111 NME9Q86XW9 330 aa25.05■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.05■■□□□ 1.6
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ODC1-201ENST00000234111 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.05■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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ODC1-201ENST00000234111 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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ODC1-201ENST00000234111 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.04■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ODC1-201ENST00000234111 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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ODC1-201ENST00000234111 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.02■■□□□ 1.6
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