RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027988.7

Ccdc3-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc3, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Col14a1Q80X19 1797 aa22.12■■□□□ 1.13
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bach1P97302 739 aa22.12■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Cd22P35329 862 aa22.11■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Wdr93Q402B2 695 aa22.11■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tsr2Q8C8T8 191 aa22.11■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Kcnb2A6H8H5 907 aa22.1■■□□□ 1.13
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm10471E9Q1C7 252 aa22.09■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gli3Q61602 1583 aa22.09■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Usp48Q3V0C5 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Fmnl2A2APV2 1086 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ttll7A4Q9F0 912 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ugt1a5B2RT14 529 aa22.08■■□□□ 1.13
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tns3Q5SSZ5 1440 aa22.08■■□□□ 1.13
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ush1cQ9ES64 910 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Col15a1O35206 1367 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Grm8P47743 908 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 VgfQ0VGU4 617 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gimap6Q8K349 305 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Kcnh5Q920E3 988 aa22.07■■□□□ 1.12
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mst1rQ62190 1378 aa22.07■■□□□ 1.12
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Zscan22Q8BGS5 496 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tmem119Q8R138 280 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pdzd9Q9D9M4 266 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 DmtnQ9WV69 405 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Sgsm2Q80U12 1005 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Sp8Q8BMJ8 486 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Slc26a8Q8R0C3 999 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mindy4Q3UQI9 744 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 AceP09470 1312 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mdm2P23804 489 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Q9D9S1 216 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Nphp3Q7TNH6 1325 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ppm1mQ8BU27 406 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ccdc178Q8CDV0 866 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Dzip1Q8BMD2 852 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Wdr24Q8CFJ9 790 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pdcl2Q78Y63 240 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ubxn10Q8BG34 277 aa22.03■■□□□ 1.12
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Zfp51Q3U4L8 781 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 HellsQ60848 821 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Slc39a6Q8C145 765 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Polr3dQ91WD1 398 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Taf7Q9R1C0 341 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Topaz1E5FYH1 1653 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tpm2P58774 284 aa22.03■■□□□ 1.12
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 TnrQ8BYI9 1358 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Becn1O88597 448 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ccdc66Q6NS45 935 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Prkab2Q6PAM0 271 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 PigbQ9JJQ0 542 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Anp32cQ64G17 123 aa22.02■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Taok2Q6ZQ29 1240 aa22.02■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Siglec1Q62230 1695 aa22.02■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Hoxa7P02830 229 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ube2hP62257 183 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Adora1Q60612 326 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Casc1Q6TDU8 730 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bach2P97303 839 aa22.01■■□□□ 1.11
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Nlrp9bQ66X22 1003 aa22■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ddx11Q6AXC6 880 aa22■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Adcy5P84309 1262 aa21.99■■□□□ 1.11
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Eef2kO08796 724 aa21.98■■□□□ 1.11
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Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa21.98■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 NmiO35309 314 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 SnrkQ8VDU5 748 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Simc1E9Q6E9 1354 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ddx60E9PZQ1 1711 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 LratQ9JI60 231 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Spata31d1bE9QA57 1361 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 ThemisQ8BGW0 636 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 OptnQ8K3K8 584 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mx2Q9WVP9 655 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Cnnm1Q0GA42 951 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Iqsec3Q3TES0 1195 aa21.96■■□□□ 1.11
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