RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027988.7

Ccdc3-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc3, Length 2,670 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Col14a1Q80X19 1797 aa22.12■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bach1P97302 739 aa22.12■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Cd22P35329 862 aa22.11■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Wdr93Q402B2 695 aa22.11■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tsr2Q8C8T8 191 aa22.11■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Irf9Q61179 399 aa22.1■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Kcnb2A6H8H5 907 aa22.1■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa22.1■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Wdr17E9Q271 1322 aa22.09■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gm10471E9Q1C7 252 aa22.09■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gli3Q61602 1583 aa22.09■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Usp48Q3V0C5 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Fmnl2A2APV2 1086 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ttll7A4Q9F0 912 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ugt1a5B2RT14 529 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tns3Q5SSZ5 1440 aa22.08■■□□□ 1.13
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pcmtd1P59913 357 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ush1cQ9ES64 910 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Col15a1O35206 1367 aa22.08■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Grm8P47743 908 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 VgfQ0VGU4 617 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Gimap6Q8K349 305 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Kcnh5Q920E3 988 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ak2Q9WTP6 239 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mst1rQ62190 1378 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 PsapQ61207 557 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Zscan22Q8BGS5 496 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tmem119Q8R138 280 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pdzd9Q9D9M4 266 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 DmtnQ9WV69 405 aa22.07■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Sgsm2Q80U12 1005 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Sp8Q8BMJ8 486 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Slc26a8Q8R0C3 999 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mindy4Q3UQI9 744 aa22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 AceP09470 1312 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mdm2P23804 489 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Q9D9S1 216 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Nphp3Q7TNH6 1325 aa22.05■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ppm1mQ8BU27 406 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ccdc178Q8CDV0 866 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Dzip1Q8BMD2 852 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Wdr24Q8CFJ9 790 aa22.04■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Pdcl2Q78Y63 240 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ubxn10Q8BG34 277 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Dmrt2Q8BG36 561 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Zfp51Q3U4L8 781 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 HellsQ60848 821 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Slc39a6Q8C145 765 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Polr3dQ91WD1 398 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Taf7Q9R1C0 341 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Topaz1E5FYH1 1653 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Tpm2P58774 284 aa22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 TnrQ8BYI9 1358 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Becn1O88597 448 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ccdc66Q6NS45 935 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Prkab2Q6PAM0 271 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 PigbQ9JJQ0 542 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa22.02■■□□□ 1.12
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Anp32cQ64G17 123 aa22.02■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Taok2Q6ZQ29 1240 aa22.02■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Siglec1Q62230 1695 aa22.02■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Hoxa7P02830 229 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ube2hP62257 183 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Adora1Q60612 326 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Casc1Q6TDU8 730 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bach2P97303 839 aa22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Dhx38Q80X98 1228 aa22■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Nlrp9bQ66X22 1003 aa22■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ddx11Q6AXC6 880 aa22■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Adcy5P84309 1262 aa21.99■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Eef2kO08796 724 aa21.98■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 GnpatP98192 678 aa21.98■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa21.98■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 NmiO35309 314 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 SnrkQ8VDU5 748 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Simc1E9Q6E9 1354 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Ddx60E9PZQ1 1711 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 LratQ9JI60 231 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Spata31d1bE9QA57 1361 aa21.97■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 ThemisQ8BGW0 636 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 OptnQ8K3K8 584 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Mx2Q9WVP9 655 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Cnnm1Q0GA42 951 aa21.96■■□□□ 1.11
Ccdc3-201ENSMUST00000027988 Iqsec3Q3TES0 1195 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.3 ms