RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 DAPP1Q9UN19 280 aa9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 SPEGQ15772 3267 aa9.16□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC154A6NI56 674 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 C4orf51C9J302 202 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 SGK494L7N484 410 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CLDN4O14493 209 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 MSTNO14793 375 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 SHOXO15266 292 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 GSC2O15499 205 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CFLARO15519 480 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 TMPRSS11DO60235 418 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA0754O94854 1291 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 AIFM1O95831 613 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV1-40P01703 118 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 GBAP04062 536 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CYC1P08574 325 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CD63P08962 238 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 FSTP19883 344 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 PIK3R1P27986 724 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 S100A3P33764 101 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 LIM2P55344 173 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 NME5P56597 212 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 SHC2P98077 582 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 OCA2Q04671 838 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf80Q0P641 193 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 KLF10Q13118 480 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 KRT72Q14CN4 511 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 MMEL1Q495T6 779 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 AGKQ53H12 422 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 COQ5Q5HYK3 327 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CPTPQ5TA50 214 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 PDSS2Q86YH6 399 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CA13Q8N1Q1 262 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 FKBP10Q96AY3 582 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL29Q96CT2 875 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 AICDAQ9GZX7 198 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CLMPQ9H6B4 373 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 NDE1Q9NXR1 346 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 ARMCX1Q9P291 453 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 SATB2Q9UPW6 733 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CTPS1-211ENST00000497210 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.15□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 AGRPO00253 132 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 AKAP10O43572 662 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 SUSD5O60279 629 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 TBX19O60806 448 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 STK17BO94768 372 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 LRATO95237 230 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 BMP10O95393 424 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 FHP07954 510 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 FURINP09958 794 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 CCL4P13236 92 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 ITIH1P19827 911 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 ITGAXP20702 1163 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 GPX3P22352 226 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 CALB2P22676 271 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 TACR1P25103 407 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 PLA2G5P39877 138 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 XCR1P46094 333 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 UFM1P61960 85 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 GABREP78334 506 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 OLR1P78380 273 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 STX5Q13190 355 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 PDE7AQ13946 482 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 FAM47BQ8NA70 645 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.14□□□□□ -0.95
CTPS1-211ENST00000497210 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.14□□□□□ -0.95
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