RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321356.8

CLK1-201, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-201ENST00000321356 ZNF221Q9UK13 617 aa8.26□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.26□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 COL4A3Q01955 1670 aa8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 NOTCH4Q99466 2003 aa8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 A0A1W2PRQ8 180 aa8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 CYP17A1P05093 508 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.25□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 LHX9Q9NQ69 397 aa8.25□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 NFE2L1Q14494 772 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 MLC1Q15049 377 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 NDUFA9Q16795 377 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 ZNF366Q8N895 744 aa8.24□□□□□ -1.09
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CLK1-201ENST00000321356 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 OTUB2Q96DC9 234 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 NUS1Q96E22 293 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 F2RL3Q96RI0 385 aa8.24□□□□□ -1.09
CLK1-201ENST00000321356 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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