RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 SPACA6W5XKT8 324 aa21.43■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 RIPK2O43353 540 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 EEDO75530 441 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 CLDN9O95484 217 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 COL8A1P27658 744 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 BSGP35613 385 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 TRAF3Q13114 568 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 C18orf63Q68DL7 685 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 REPS1Q96D71 796 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 TMCO1Q9UM00 188 aa21.42■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 A0A0A6YYD5 115 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 A0A1B0GTL3 188 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 TMPRSS11DO60235 418 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ZG16O60844 167 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 SMIM24O75264 130 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ZFAND5O76080 213 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 TNFRSF17Q02223 184 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 CUL3Q13618 768 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 SERTAD2Q14140 314 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 RNFT1Q5M7Z0 435 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 FAM219BQ5XKK7 198 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 GPR180Q86V85 440 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 SIAH3Q8IW03 269 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 MORN4Q8NDC4 146 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 OR14A16Q8NHC5 309 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 RELTQ969Z4 430 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 CCDC77Q9BR77 488 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 CENPKQ9BS16 269 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 NTMT1Q9BV86 223 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 OR8D2Q9GZM6 311 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.41■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 A0A1B0GUH1 482 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 WASHC1A8K0Z3 465 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 A8MT66 165 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 C17orf105B2RV13 164 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 CCNG1P51959 295 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ARFIP1P53367 373 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 PHEXP78562 749 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 MDGA2Q7Z553 956 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 SLC2A12Q8TD20 617 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 GPR137Q96N19 417 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 PHF11Q9UIL8 331 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 ASB4Q9Y574 426 aa21.4■■□□□ 1.02
PSME4-208ENST00000481518 A0A1W2PR48 441 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 NPIPA5E9PKD4 350 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 PPP6CO00743 305 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 OR2J2O76002 312 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 TNNI3P19429 210 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 SSR4P51571 173 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 PER3P56645 1201 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 FOLH1Q04609 750 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 HSDL2Q6YN16 418 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 TMEM156Q8N614 296 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 TMEM125Q96AQ2 219 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 MYOTQ9UBF9 498 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 PPT2Q9UMR5 302 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 NPIPA1Q9UND3 350 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 MAST4O15021 2626 aa21.39■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa21.38■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 WWP2O00308 870 aa21.38■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 PROM1O43490 865 aa21.38■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 GBAP04062 536 aa21.38■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 TSPAN8P19075 237 aa21.38■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 STT3AP46977 705 aa21.38■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 HK2P52789 917 aa21.38■■□□□ 1.01
PSME4-208ENST00000481518 CDH13P55290 713 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms