RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT4Q9NZJ9 180 aa24.36■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF793Q6ZN11 406 aa24.34■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACOT4Q8N9L9 421 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMRTA2Q96SC8 542 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB17Q9H0T7 212 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOTQ9UBF9 498 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OPTCQ9UBM4 332 aa24.34■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBF1Q8TES7 1133 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa24.33■■□□□ 1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8D2Q9GZM6 311 aa24.33■■□□□ 1.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 K7EPI3 171 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBXN8O00124 270 aa24.32■■□□□ 1.48
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KERAO60938 352 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDB3O75112 727 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPOP07202 933 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB1P30740 379 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASQ1P31415 396 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAB1Q13506 487 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP5B1Q2VPB7 878 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL20RBQ6UXL0 311 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHSY3Q70JA7 882 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBTD2Q8WUN7 234 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASL10BQ96S79 203 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATOH8Q96SQ7 321 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDZD2O15018 2839 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf105B2RV13 164 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf84I3L1E1 186 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3BGRLO75368 114 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6B1O95007 311 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGFB1P01137 390 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX3P41225 446 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSR2P43308 183 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD163Q86VB7 1156 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR7G3Q8NG95 312 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMTM7Q96FZ5 175 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM8Q9BZR9 551 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF5Q9NSI5 407 aa24.31■■□□□ 1.48
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNA1CQ13936 2221 aa24.3■■□□□ 1.48
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