RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ARL6IP5O75915 188 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 GP1BBP13224 206 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 FAM189BP81408 668 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DPY19L1Q2PZI1 675 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 AGAP5A6NIR3 686 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 TPPPO94811 219 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 EVI2BP34910 448 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 GLP1RP43220 463 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 NCS1P62166 190 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ELP2Q6IA86 826 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 OR13C3Q8NGS6 347 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ITFG2Q969R8 447 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 CD244Q9BZW8 370 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 GPR83Q9NYM4 423 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 GOSR2O14653 212 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC22A2O15244 555 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 EPCAMP16422 314 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 PTPN6P29350 595 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SSTR4P31391 388 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 FBXO43Q4G163 708 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ESX1Q8N693 406 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 TNFP01375 233 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ADH5P11766 374 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 PRKCZQ05513 592 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 MAP4K2Q12851 820 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 C14orf80Q86SX3 495 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 B8ZZF3 427 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM44Q2T9K0 475 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 OSTM1Q86WC4 334 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 OR4N5Q8IXE1 308 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 FBP2O00757 339 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 OR2B3O76000 313 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 RAB4AP20338 218 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 PRR18Q8N4B5 295 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 WDR45Q9Y484 360 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 PCDH17O14917 1159 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF45Q02386 682 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 LMF1Q96S06 567 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 CCDC106Q9BWC9 280 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 Q9N2J8 555 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 USP32Q8NFA0 1604 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 AGPAT2O15120 278 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ADAP00813 363 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 FHP07954 510 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 RAB5BP61020 215 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DECR1Q16698 335 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 RFPL1O75677 317 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 MT-ND2P03891 347 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DYRK1AQ13627 763 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 MAL2Q969L2 176 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SCRN2Q96FV2 425 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 IL17FQ96PD4 163 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 MMP28Q9H239 520 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 APEHP13798 732 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF550Q7Z398 422 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 A0A0U1RQS6 177 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 OR6C6A6NF89 314 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 CPNE6O95741 557 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 CAPNS1P04632 268 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 SQSTM1Q13501 440 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 TEAD2Q15562 447 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 UBQLNLQ8IYU4 475 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 NELL2Q99435 816 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 GNG13Q9P2W3 67 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms