RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223073.6

RBM28-201, Transcript of RNA binding motif protein 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RBM28, Length 15,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28-201ENST00000223073 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 WNT8BQ93098 351 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 KCNC2Q96PR1 638 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 CD34P28906 385 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ACTC1P68032 377 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ACTA1P68133 377 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 PEX6Q13608 980 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 CHST4Q8NCG5 386 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 OR52J3Q8NH60 311 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 DKKL1Q9UK85 242 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TOXO94900 526 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ZNF546Q86UE3 836 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 NFYBP25208 207 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 GTF2BQ00403 316 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 MEF2DQ14814 521 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ADGRF1Q5T601 910 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 KPTNQ9Y664 436 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 A0A1W2PQ09 198 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ALPPP05187 535 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 IRF4Q15306 451 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SYT14Q8NB59 555 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 AZIN2Q96A70 460 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 FAM117AQ9C073 453 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 OCEL1Q9H607 264 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 STK16O75716 305 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 CSTAP01040 98 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SNCAP37840 140 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 PPP4CP60510 307 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SLC17A1Q14916 467 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 LRFN1Q9P244 771 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 PGAM2P15259 253 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 CAMLGP49069 296 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 FABP6P51161 128 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SHEQ5VZ18 495 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 CDH26Q8IXH8 852 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 PLPP6Q8IY26 295 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 OR4L1Q8NH43 312 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 GGHQ92820 318 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 A8MXE2 369 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 LY86O95711 162 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 USP41Q3LFD5 358 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 BCL7AQ4VC05 210 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 OTUB2Q96DC9 234 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 EPYCQ99645 322 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 PKIBQ9C010 78 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 F5H5T6 163 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 HCRTR2O43614 444 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 TNFRSF17Q02223 184 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 CIPCQ9C0C6 399 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 FAAHO00519 579 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 RAMP2O60895 175 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 URODP06132 367 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 GM2AP17900 193 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 CASRP41180 1078 aa6.63□□□□□ -1.35
RBM28-201ENST00000223073 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms