RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTS20P59510 1910 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0J9YVX5 310 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PQM1 296 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 PRAMEF4O60810 478 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 DCTN3O75935 186 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SERPINA6P08185 405 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00032P0C843 101 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 PRPH2P23942 346 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SERPINB3P29508 390 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CCKBRP32239 447 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SEPHS1P49903 392 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 HTR6P50406 440 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CBX1P83916 185 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CUL3Q13618 768 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 FXNQ16595 210 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC157Q569K6 752 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 EPGNQ6UW88 154 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 NUDT13Q86X67 352 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 D2HGDHQ8N465 521 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB124Q8NES8 71 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 OR8K5Q8NH50 307 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 NT5CQ8TCD5 201 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SLC13A3Q8WWT9 602 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 STARD8Q92502 1023 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 QRFPRQ96P65 431 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 KCNC2Q96PR1 638 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 HBEGFQ99075 208 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 MS4A8Q9BY19 250 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ACPTQ9BZG2 426 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf109Q9NX04 203 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 PDP2Q9P2J9 529 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 STOML1Q9UBI4 398 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 A8MU76 341 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SDHDO14521 159 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CTSVO60911 334 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 CEACAM1P13688 526 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 LBPP18428 481 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 EPHA3P29320 983 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ADMP35318 185 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 SSR2P43308 183 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 GSTM5P46439 218 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 LSSP48449 732 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ITGA1P56199 1179 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 ERVK-8P63133 956 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 TUBB3Q13509 450 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 GRM7Q14831 915 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 HERC3Q15034 1050 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-211ENST00000497210 GALNTL6Q49A17 601 aa9.24□□□□□ -0.93
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