RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMACHCQ9Y4U1 282 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPA5E9PKD4 350 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A12O75746 678 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIAS1O75925 651 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB561P49447 251 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGFBIQ15582 683 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3AR1Q16581 482 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT78Q8N1N4 520 aa24.5■■□□□ 1.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.5■■□□□ 1.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.5■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NME2P22392 152 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTM2P28161 218 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCAIMQ8N3R3 496 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKL2Q92772 493 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5DC2Q9H857 520 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPRC5BQ9NZH0 403 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TINAGQ9UJW2 476 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF835Q9Y2P0 537 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JN53 185 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRIT2A6NDA9 550 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCHO1O14526 889 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERI3O43414 337 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRF1P14222 555 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRNP28799 593 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSTR1P30872 391 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLCSP50747 726 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUNX2Q13950 521 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPSM1Q86YR5 675 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIAH3Q8IW03 269 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA6LQ8N4H0 392 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM125Q96AQ2 219 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A6EQ96DS6 147 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WWOXQ9NZC7 414 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APCP25054 2843 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A088AWK7 358 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKDD1BA6NHY2 528 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAPBPO15533 448 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASNA1O43681 348 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO1DO94832 1006 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC166P0CW27 439 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF8P28908 595 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALCOCO2Q13137 446 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF227Q86WZ6 799 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC10Q8N2F6 343 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GNT7Q8NFL0 401 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM79Q9BSE2 394 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPH5Q9H2P9 285 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLGNO14967 610 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GALT2O43825 422 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC3AO75596 197 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF24P17028 368 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTR1EP28566 365 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGT5P36269 586 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCN2P51788 898 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TERF2Q15554 542 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XKRXQ6PP77 449 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCUBE1Q8IWY4 988 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCEMP1Q8IX19 187 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPNE1Q99829 537 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERP44Q9BS26 406 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EHD1Q9H4M9 534 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WHRNQ9P202 907 aa24.46■■□□□ 1.51
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