RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 GGT5P36269 586 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 RPA4Q13156 261 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 TIGD6Q17RP2 521 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 CPXM2Q8N436 756 aa16.44■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 UPB1Q9UBR1 384 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 C1orf226A1L170 272 aa16.44■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 ARHGDIBP52566 201 aa16.44■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 CHD4Q14839 1912 aa16.44■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.43■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.43■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 DRD2P14416 443 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 VLDLRP98155 873 aa16.43■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.43■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 PON3Q15166 354 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 FAM189A2Q15884 450 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 RABL3Q5HYI8 236 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.43■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.43■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 WASH3PC4AMC7 463 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 ZNF20P17024 532 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 DRD1P21728 446 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 P4HA3Q7Z4N8 544 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 CEP97Q8IW35 865 aa16.42■□□□□ 0.22
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NISCH-213ENST00000489895 RNF121Q9H920 327 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 DRGXA6NNA5 263 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF15O94989 841 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 SLC6A6P31641 620 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 RABIFP47224 123 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 PKP2Q99959 881 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 KAT6AQ92794 2004 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-213ENST00000489895 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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