RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375556.8

FAM20A-202, Transcript of FAM20A, golgi associated secretory pathway pseudokinase, humanhuman

TSL 2

Gene FAM20A, Length 2,081 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20A-202ENST00000375556 ATG9BQ674R7 924 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 MFSD4AQ8N468 514 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 SVOPQ8N4V2 548 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 FAR1Q8WVX9 515 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 YIPF6Q96EC8 236 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 USP22Q9UPT9 525 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 A0A1W2PQ67 120 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ELOVL7A1L3X0 281 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 FAM220BPB1ANY3 271 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CDC7O00311 574 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 BTN3A1O00481 513 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 FKBP9O95302 570 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ELFN1P0C7U0 828 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 AKT2P31751 481 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 VIPR1P32241 457 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 NUDT1P36639 197 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 IL2P60568 153 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 KEAP1Q14145 624 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 OR13H1Q8NG92 308 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 RORBQ92753 470 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PPM1MQ96MI6 270 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ACTL8Q9H568 366 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 SP140LQ9H930 580 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 C4orf47A7E2U8 309 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 M0R3G1 203 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TLR4O00206 839 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 GNGT2O14610 69 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 OR4F21O95013 312 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TSPAN12O95859 305 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 IGFALSP35858 605 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 RXRGP48443 463 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TTPAP49638 278 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 MAPK10P53779 464 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 MTPNP58546 118 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PTSQ03393 145 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CYP4F3Q08477 520 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 SELPLGQ14242 412 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CDKN3Q16667 212 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 IMPG1Q17R60 797 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 HLA-BQ31612 363 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 LRRC66Q68CR7 880 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 SLC13A3Q8WWT9 602 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ASB12Q8WXK4 309 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 KCNJ9Q92806 393 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 RMDN1Q96DB5 314 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 GPR21Q99679 349 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 DUSP21Q9H596 190 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 GALPQ9UBC7 116 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 V9GYQ6 96 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 KDM1AO60341 852 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 PRKD3O94806 890 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CLDN7O95471 211 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 IL6P05231 212 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CD40LGP29965 261 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 FMO4P31512 558 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 DCTP40126 519 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ETV3P41162 512 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CTSKP43235 329 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 FADDQ13158 208 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 CDK5R2Q13319 367 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 IRF4Q15306 451 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TEAD4Q15561 434 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 STPG1Q5TH74 334 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM20A-202ENST00000375556 TMEM53Q6P2H8 277 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms