RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJ-207ENST00000613246 SYNCQ9H7C4 482 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 MTHFSP49914 203 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-207ENST00000613246 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJ-207ENST00000613246 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRJ-207ENST00000613246 NDC80O14777 642 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRJ-207ENST00000613246 SATB1Q01826 763 aa21.41■■□□□ 1.02
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PTPRJ-207ENST00000613246 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
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PTPRJ-207ENST00000613246 CEP120Q8N960 986 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRJ-207ENST00000613246 GMNNO75496 209 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP3K9P80192 1104 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 DYNC1I1O14576 645 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-207ENST00000613246 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.34■■□□□ 1.01
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