RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, human

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGCR6-208	ENST00000608842	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		29.36	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		29.36	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	GCC1	Q96CN9	775 aa		29.36	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	HYPK	Q9NX55	129 aa		29.36	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	NUCB1	Q02818	461 aa		29.35	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.35	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		29.34	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	JCAD	Q9P266	1359 aa		29.34	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	CERK	Q8TCT0	537 aa		29.34	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	BEND3	Q5T5X7	828 aa		29.33	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		29.33	■■■□□ 2.29
DGCR6-208	ENST00000608842	C8orf34	Q49A92	452 aa		29.32	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	USP44	Q9H0E7	712 aa		29.32	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	GNAI3	P08754	354 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	FAM161A	Q3B820	660 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	KSR2	Q6VAB6	950 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	DCTPP1	Q9H773	170 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.3	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	EXOC5	O00471	708 aa		29.29	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	GNAI2	P04899	355 aa		29.29	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		29.28	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		29.27	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		29.27	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		29.27	■■■□□ 2.28
DGCR6-208	ENST00000608842	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		29.25	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	PIGB	Q92521	554 aa		29.25	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.25	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	MYL6B	P14649	208 aa		29.24	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	LNPK	Q9C0E8	428 aa		29.24	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	BCL9	O00512	1426 aa		29.24	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		29.23	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		29.23	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	ERBB4	Q15303	1308 aa		29.22	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.22	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		29.22	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		29.22	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	COPS6	Q7L5N1	327 aa		29.21	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	ALDH1L1	O75891	902 aa		29.2	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	ATG3	Q9NT62	314 aa		29.2	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		29.2	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.27
DGCR6-208	ENST00000608842	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		29.2	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.2	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	ATP8B2	P98198	1209 aa		29.2	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	NBPF14	Q5TI25	921 aa		29.2	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	NBPF15	Q8N660	670 aa		29.2	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	DDB1	Q16531	1140 aa		29.19	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	HMMR	O75330	724 aa		29.18	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	C8orf37	Q96NL8	207 aa		29.18	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		29.17	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	LINS1	Q8NG48	757 aa		29.17	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	NGLY1	Q96IV0	654 aa		29.16	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	IGKV5-2	P06315	115 aa		29.15	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	VPS72	Q15906	364 aa		29.15	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		29.15	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		29.15	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	TJP1	Q07157	1748 aa		29.14	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		29.14	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
DGCR6-208	ENST00000608842	UTY	O14607	1347 aa		29.14	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	A1BG	P04217	495 aa		29.13	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	SSH3	Q8TE77	659 aa		29.12	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	HSPA1L	P34931	641 aa		29.1	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	POLA2	Q14181	598 aa		29.1	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		29.09	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		29.09	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	GRM8	O00222	908 aa		29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	MYD88	Q99836	296 aa		29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
DGCR6-208	ENST00000608842	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
DGCR6-208	ENST00000608842	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		29.06	■■■□□ 2.24
DGCR6-208	ENST00000608842	MTX1	Q13505	466 aa		29.06	■■■□□ 2.24
DGCR6-208	ENST00000608842	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		29.06	■■■□□ 2.24

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