RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 SMAPO00193 183 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 USP6P35125 1406 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 HOMEZQ8IX15 550 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3R4Q99570 1358 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 USP31Q70CQ4 1352 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 HMOX1P09601 288 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 OSBPP22059 807 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF10O15013 1369 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 C14orf37Q86TY3 774 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 TNNQ9UQP3 1299 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF853P0CG23 659 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM57Q8N5G2 664 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR70Q9NW82 654 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 TBX22Q9Y458 520 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 ACEP12821 1306 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SMC5Q8IY18 1101 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 FLT4P35916 1363 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS12P56730 875 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 PACS2Q86VP3 889 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRUQ92729 1446 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 GCC1Q96CN9 775 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 MBIPQ9NS73 344 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC4O15439 1325 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 USP54Q70EL1 1684 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SBNO1A3KN83 1393 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0232Q92628 1395 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SSH2Q76I76 1423 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 VAMP4O75379 141 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 LRCH3Q96II8 777 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 LTKP29376 864 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 PEAK1Q9H792 1746 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 NUCB1Q02818 461 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 USP19O94966 1318 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 FBLN1P23142 703 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 TATDN2Q93075 761 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRCP08575 1304 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 RTL1A6NKG5 1358 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3C2AO00443 1686 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS20O76081 388 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 NFKBIBQ15653 356 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 KDRP35968 1356 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 PNMA3Q9UL41 463 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC37A3O60309 1634 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 CHL1O00533 1208 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC4A3P48751 1232 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms