RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571145.1

TP53BP1-215, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 431 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-215	ENST00000571145	LDHD	Q86WU2	507 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	EYA1	Q99502	592 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	KDR	P35968	1356 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	NCAPD2	Q15021	1401 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	RPS6KA4	O75676	772 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CDCA8	Q53HL2	280 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	PHKG2	P15735	406 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	TTLL6	Q8N841	843 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CAPNS2	Q96L46	248 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	POLK	Q9UBT6	870 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	SPG7	Q9UQ90	795 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		6.99	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	AOC2	O75106	756 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	TM4SF1	P30408	202 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CNTROB	Q8N137	903 aa		6.98	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	SCN4A	P35499	1836 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	C21orf2	O43822	256 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TP53BP1-215	ENST00000571145	ECE1	P42892	770 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		6.96	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3	2e-6	■■■■□ 25.1
TP53BP1-215	ENST00000571145		H0YIN7	160 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	EPHX2	P34913	555 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	NFIX	Q14938	502 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	6.95	□□□□□ -1.3	9e-7	■■■□□ 14.9
TP53BP1-215	ENST00000571145	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	PANK3	Q9H999	370 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	HACL1	Q9UJ83	578 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		6.95	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	SERPINB2	P05120	415 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	MAP2K2	P36507	400 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	CABP4	P57796	275 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		6.94	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	TJP1	Q07157	1748 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	TRAF5	O00463	557 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	CA12	O43570	354 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	ZPR1	O75312	459 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	CST9	Q5W186	159 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	GCC1	Q96CN9	775 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		6.93	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	CACNA1S	Q13698	1873 aa		6.92	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	DLL1	O00548	723 aa		6.92	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	MTHFS	P49914	203 aa		6.92	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	6.92	□□□□□ -1.3
TP53BP1-215	ENST00000571145	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		6.92	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.2 ms