RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561853.1

BBS2-202, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 3

Gene BBS2, Length 473 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-202ENST00000561853 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
BBS2-202ENST00000561853 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.02■□□□□ -0
BBS2-202ENST00000561853 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
BBS2-202ENST00000561853 ERBB4Q15303 1308 aa15.01□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 C5P01031 1676 aa15.01□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.01□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 USP16Q9Y5T5 823 aa15.01□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 AAMPQ13685 434 aa15□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 PDIA6Q15084 440 aa15□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 PROSER3Q2NL68 480 aa15□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 HYPKQ9NX55 129 aa15□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 DDX19BQ9UMR2 479 aa15□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 ITGB4P16144 1822 aa14.99□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 KCNQ2O43526 872 aa14.99□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 ANXA1P04083 346 aa14.99□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.98□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.98□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.98□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.97□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.97□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.97□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.97□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.97□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 PALLDQ8WX93 1383 aa14.97□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 F6X3S4 739 aa14.96□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 RXRBP28702 533 aa14.96□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 FAM182BQ5T319 152 aa14.96□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
BBS2-202ENST00000561853 STARD3NLO95772 234 aa14.95□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 MYL6BP14649 208 aa14.95□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 NHSQ6T4R5 1651 aa14.95□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 ADCY9O60503 1353 aa14.95□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 NBPF26B4DH59 902 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 A1BGP04217 495 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 SIK1P57059 783 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 NBPF14Q5TI25 921 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 NBPF15Q8N660 670 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.94□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 KSR2Q6VAB6 950 aa14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 COPS6Q7L5N1 327 aa14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.93□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 ATP10DQ9P241 1426 aa14.92□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 POTEAQ6S8J7 498 aa14.92□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 ATP6V1AP38606 617 aa14.91□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 BEND3Q5T5X7 828 aa14.91□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.91□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 TJP1Q07157 1748 aa14.91□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 ITPK1Q13572 414 aa14.9□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.9□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.9□□□□□ -0.02
BBS2-202ENST00000561853 CACNA1FO60840 1977 aa14.89□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.89□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.89□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.89□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.89□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 ALDH1L1O75891 902 aa14.88□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.88□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.88□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 MEIS3Q99687 375 aa14.88□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 LINS1Q8NG48 757 aa14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 BTAF1O14981 1849 aa14.87□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 GNAI3P08754 354 aa14.86□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.86□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.86□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.86□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 RREB1Q92766 1687 aa14.85□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 TRIM37O94972 964 aa14.85□□□□□ -0.03
BBS2-202ENST00000561853 IGHDP01880 384 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms