RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 CCER2I3L3R5 266 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 KCNQ3O43525 872 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 RPS6KA4O75676 772 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SPON1Q9HCB6 807 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 BCORQ6W2J9 1755 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CS-213ENST00000548746 APAF1O14727 1248 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 GNPATO15228 680 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NGEFQ8N5V2 710 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 CHL1O00533 1208 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ZBTB7AO95365 584 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 STARD3NLO95772 234 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ZNF853P0CG23 659 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 COL15A1P39059 1388 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 RGL2O15211 777 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 CFAP44Q96MT7 982 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 IFT57Q9NWB7 429 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ERBB4Q15303 1308 aa7.75□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 HOXB7P09629 217 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 IL16Q14005 1332 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ZNF521Q96K83 1311 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 PHF14O94880 888 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 GYS1P13807 737 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NEUROD2Q15784 382 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 WWC1Q8IX03 1113 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NARFQ9UHQ1 456 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 USP16Q9Y5T5 823 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 CACNA1FO60840 1977 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 A0A087WZG4 1122 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NBPF26B4DH59 902 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 POLD1P28340 1107 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 RFC4P35249 363 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 GNAI1P63096 354 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 SMIM5Q71RC9 77 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 WDR63Q8IWG1 891 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NBPF15Q8N660 670 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 ARXQ96QS3 562 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 MBIPQ9NS73 344 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 NUP98P52948 1817 aa7.71□□□□□ -1.17
CS-213ENST00000548746 CAMTA2O94983 1202 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 A1BGP04217 495 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.71□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 TM4SF1P30408 202 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 FKBP8Q14318 412 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 PDIA6Q15084 440 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 MSL1Q68DK7 614 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 ATP10DQ9P241 1426 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 ZPR1O75312 459 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 MMP10P09238 476 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 DDR1Q08345 913 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 KRT24Q2M2I5 525 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 MIER1Q8N108 512 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 SYT17Q9BSW7 474 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CS-213ENST00000548746 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.68□□□□□ -1.18
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