RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 TOMM22Q9NS69 142 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 C8orf34Q49A92 452 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 DYNC1I1O14576 645 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 HOXB7P09629 217 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 ST18O60284 1047 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 HMMRO75330 724 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 MSH6P52701 1360 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 NLRP6P59044 892 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 SLIT3O75094 1523 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CLGNO14967 610 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 IGHDP01880 384 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 MAP3K5Q99683 1374 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 RLBP1P12271 317 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 STK31Q9BXU1 1019 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CRB1P82279 1406 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PSME1Q06323 249 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 IP6K1Q92551 441 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PANK2Q9BZ23 570 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 NFAT5O94916 1531 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 HOXC9P31274 260 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CACNA1FO60840 1977 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 NUCB1Q02818 461 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 ABTB2Q8N961 1025 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 MCM2P49736 904 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 MNS1Q8NEH6 495 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 DCTN1Q14203 1278 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB9Q96C00 473 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 TDO2P48775 406 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 TUBB4BP68371 445 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 HOMER1Q86YM7 354 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 GORABQ5T7V8 394 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 GNAI3P08754 354 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 MCM4P33991 863 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 USP19O94966 1318 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRD-214ENST00000540109 CAGE1Q8TC20 777 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 APBB1O00213 710 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 EYA1Q99502 592 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 TMX1Q9H3N1 280 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 LTN1O94822 1766 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 BANK1Q8NDB2 785 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 SPC24Q8NBT2 197 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms