RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF15Q8N660 670 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 CABP1Q9NZU7 370 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 SOBPA7XYQ1 873 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 POU4F2Q12837 409 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 C4orf17Q53FE4 359 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXO3O43524 673 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 RHOQP17081 205 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 PHKA2P46019 1235 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G4AP47712 749 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 GNASQ5JWF2 1037 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF232Q9UNY5 417 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 SERTM1A2A2V5 107 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 EML1O00423 815 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 NOS2P35228 1153 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 TEAD4Q15561 434 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 TXLNAP40222 546 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNA1Q09470 495 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEAQ6S8J7 498 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC16A10Q8TF71 515 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 NGLY1Q96IV0 654 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 SEPT3Q9UH03 358 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 MAN1A2O60476 641 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINB4P48594 390 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 GMPRP36959 345 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 AIDAQ96BJ3 306 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 COL26A1Q96A83 441 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BM21 787 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ABL1P00519 1130 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP4AP20648 1035 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 VEGFBP49765 207 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR44Q5JSH3 913 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 IRF7Q92985 503 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 GPAMQ9HCL2 828 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ANO2Q9NQ90 1003 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 ERBB4Q15303 1308 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 NISCHQ9Y2I1 1504 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GTH6 734 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 MSX1P28360 303 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 PTSQ03393 145 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 MTMR3Q13615 1198 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 COX20Q5RI15 118 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 C16orf46Q6P387 395 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 KLRG1Q96E93 195 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.466e-6■□□□□ 11
RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 MTMR7Q9Y216 660 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35F4A4IF30 521 aa5.92□□□□□ -1.46
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