RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.97■■□□□ 1.91
SCAF8-204ENST00000461219 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SCAF8-204ENST00000461219 KCNQ3O43525 872 aa26.95■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 ZPR1O75312 459 aa26.94■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.94■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.94■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.93■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.92■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 COL15A1P39059 1388 aa26.91■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 MMP10P09238 476 aa26.9■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 MRS2Q9HD23 443 aa26.89■■□□□ 1.9
SCAF8-204ENST00000461219 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.89■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 A0A087WZG4 1122 aa26.88■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 GYS1P13807 737 aa26.88■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.88■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.87■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.85■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.85■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 A1BGP04217 495 aa26.84■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 GPR162Q16538 588 aa26.84■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 NARFQ9UHQ1 456 aa26.84■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 USP16Q9Y5T5 823 aa26.83■■□□□ 1.89
SCAF8-204ENST00000461219 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 FKBP8Q14318 412 aa26.82■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.82■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.81■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC184Q52MB2 194 aa26.81■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 APAF1O14727 1248 aa26.8■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.79■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.78■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 SCN7AQ01118 1682 aa26.78■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 CHD4Q14839 1912 aa26.77■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.77■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.77■■□□□ 1.88
SCAF8-204ENST00000461219 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 BCORQ6W2J9 1755 aa26.75■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.74■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 NPHP1O15259 732 aa26.72■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 DDR1Q08345 913 aa26.71■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 NFIXQ14938 502 aa26.71■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 NGEFQ8N5V2 710 aa26.71■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.71■■□□□ 1.87
SCAF8-204ENST00000461219 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 TM4SF1P30408 202 aa26.7■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.7■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.7■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 MYL6BP14649 208 aa26.69■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.69■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 CHL1O00533 1208 aa26.68■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 TGFB2P61812 414 aa26.68■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.68■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 NBPF26B4DH59 902 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 GRIN3BO60391 1043 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 YY1P25490 414 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 NBPF15Q8N660 670 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 CFAP44Q96MT7 982 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 SETDB2Q96T68 719 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 CAMTA2O94983 1202 aa26.66■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 SERPINB2P05120 415 aa26.66■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 GNAI1P63096 354 aa26.66■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.66■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 NUP98P52948 1817 aa26.65■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 ERBB4Q15303 1308 aa26.65■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.64■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 A0A0G2JLW4 131 aa26.64■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 NECTIN2Q92692 538 aa26.64■■□□□ 1.86
SCAF8-204ENST00000461219 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.64■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.63■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.63■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 IFT57Q9NWB7 429 aa26.63■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.853e-11■□□□□ 8.7
SCAF8-204ENST00000461219 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.62■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 MBIPQ9NS73 344 aa26.62■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 DPEP1P16444 411 aa26.61■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 BCS1LQ9Y276 419 aa26.6■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SCAF8-204ENST00000461219 ST5P78524 1137 aa26.59■■□□□ 1.85
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