RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 GCC1Q96CN9 775 aa28.6■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.59■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 ADCY9O60503 1353 aa28.59■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.59■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 LRP6O75581 1613 aa28.59■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 EXOC5O00471 708 aa28.58■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 BACH2Q9BYV9 841 aa28.58■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 PDIA6Q15084 440 aa28.58■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 CEP85Q6P2H3 762 aa28.58■■■□□ 2.17
CHST6-202ENST00000390664 GNAI3P08754 354 aa28.57■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.57■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.57■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 USP16Q9Y5T5 823 aa28.57■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.56■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 GNAI2P04899 355 aa28.55■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.55■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.55■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 NUCB1Q02818 461 aa28.55■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 KSR2Q6VAB6 950 aa28.54■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 BEND3Q5T5X7 828 aa28.54■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 MYL6BP14649 208 aa28.53■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 FAM161AQ3B820 660 aa28.53■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.53■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.53■■■□□ 2.16
CHST6-202ENST00000390664 USP44Q9H0E7 712 aa28.52■■■□□ 2.16
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CHST6-202ENST00000390664 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.51■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 C8orf37Q96NL8 207 aa28.51■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.5■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 DDB1Q16531 1140 aa28.5■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.5■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 DCTPP1Q9H773 170 aa28.5■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.49■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 LNPKQ9C0E8 428 aa28.49■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 HMMRO75330 724 aa28.49■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 PIGBQ92521 554 aa28.49■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 NGLY1Q96IV0 654 aa28.49■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 C8orf34Q49A92 452 aa28.48■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 BARGINQ6ZT62 677 aa28.48■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 ERBB4Q15303 1308 aa28.48■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.47■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.47■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.46■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 BCL9O00512 1426 aa28.46■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 COPS6Q7L5N1 327 aa28.46■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.46■■■□□ 2.15
CHST6-202ENST00000390664 ALDH1L1O75891 902 aa28.45■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.45■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
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CHST6-202ENST00000390664 LINS1Q8NG48 757 aa28.42■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 ATG3Q9NT62 314 aa28.42■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 VPS72Q15906 364 aa28.42■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 ATP8B2P98198 1209 aa28.41■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.41■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 NBPF26B4DH59 902 aa28.39■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.39■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 NBPF14Q5TI25 921 aa28.39■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.39■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 NBPF15Q8N660 670 aa28.39■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CHST6-202ENST00000390664 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.39■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 HSPA1LP34931 641 aa28.39■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.38■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 A1BGP04217 495 aa28.38■■■□□ 2.13
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CHST6-202ENST00000390664 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 USP21Q9UK80 565 aa28.36■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 IGKV5-2P06315 115 aa28.35■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 MYD88Q99836 296 aa28.35■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 GRM8O00222 908 aa28.34■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.34■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.34■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.34■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 APBB1O00213 710 aa28.33■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.33■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 SSH3Q8TE77 659 aa28.33■■■□□ 2.13
CHST6-202ENST00000390664 UTYO14607 1347 aa28.32■■■□□ 2.12
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