RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 SEC24BO95487 1268 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 DCTPP1Q9H773 170 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 CYP27B1O15528 508 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 MRC1P22897 1456 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 DCAF5Q96JK2 942 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 GNAI2P04899 355 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 ANXA1P04083 346 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 GNAI3P08754 354 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF790Q6PG37 636 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 LRP6O75581 1613 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 SLC39A6Q13433 755 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 TRAK2O60296 914 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 PTMSP20962 102 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 HMMRO75330 724 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 STRN4Q9NRL3 753 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 TPM2P07951 284 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 PROSER3Q2NL68 480 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-204ENST00000352260 ADCY9O60503 1353 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 USP44Q9H0E7 712 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 C5P01031 1676 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 EVA1CP58658 441 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 IL2RBP14784 551 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 ESPNB1AK53 854 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 CABP4P57796 275 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 BEND3Q5T5X7 828 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTS2O95450 1211 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 HYPKQ9NX55 129 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 ATP8B2P98198 1209 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 ZMYND15Q9H091 742 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 PDIA6Q15084 440 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 PANK2Q9BZ23 570 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-204ENST00000352260 KSR2Q6VAB6 950 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 BTG4Q9NY30 223 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 APBB1O00213 710 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 GLI3P10071 1580 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 C8orf37Q96NL8 207 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 ALDH1L1O75891 902 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 HSCBQ8IWL3 235 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 USP16Q9Y5T5 823 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 DDIT3P35638 169 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-204ENST00000352260 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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