RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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SPHK1-201ENST00000323374 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.77■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 KSR2Q6VAB6 950 aa26.77■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 USP26Q9BXU7 913 aa26.77■■□□□ 1.88
SPHK1-201ENST00000323374 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 RAB11FIP3O75154 756 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 PROSER3Q2NL68 480 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF790Q6PG37 636 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 BRINP3Q76B58 766 aa26.76■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.75■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 ALDH1L1O75891 902 aa26.75■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 SRGAP3O43295 1099 aa26.74■■□□□ 1.87
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SPHK1-201ENST00000323374 GSE1Q14687 1217 aa26.74■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 REC8O95072 547 aa26.74■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 STAP2Q9UGK3 403 aa26.74■■□□□ 1.87
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SPHK1-201ENST00000323374 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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SPHK1-201ENST00000323374 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 SLC39A6Q13433 755 aa26.72■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 DCAF5Q96JK2 942 aa26.72■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 ERC2O15083 957 aa26.71■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 RABEP1Q15276 862 aa26.71■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.71■■□□□ 1.87
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SPHK1-201ENST00000323374 AOX1Q06278 1338 aa26.7■■□□□ 1.87
SPHK1-201ENST00000323374 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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SPHK1-201ENST00000323374 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.69■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 CYP27B1O15528 508 aa26.68■■□□□ 1.86
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SPHK1-201ENST00000323374 PDIA6Q15084 440 aa26.68■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.68■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.68■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 MTX1Q13505 466 aa26.67■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 LINS1Q8NG48 757 aa26.67■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 SLAIN2Q9P270 581 aa26.66■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 MRC1P22897 1456 aa26.66■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.66■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 STRCQ7RTU9 1775 aa26.65■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.65■■□□□ 1.86
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SPHK1-201ENST00000323374 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.65■■□□□ 1.86
SPHK1-201ENST00000323374 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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SPHK1-201ENST00000323374 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.62■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.62■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 C5P01031 1676 aa26.61■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 UTYO14607 1347 aa26.61■■□□□ 1.85
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SPHK1-201ENST00000323374 CHMLP26374 656 aa26.61■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 MCM4P33991 863 aa26.61■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 CABP4P57796 275 aa26.61■■□□□ 1.85
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SPHK1-201ENST00000323374 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.59■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.59■■□□□ 1.85
SPHK1-201ENST00000323374 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.57■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 ST18O60284 1047 aa26.57■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 COPS6Q7L5N1 327 aa26.57■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.57■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 USP16Q9Y5T5 823 aa26.57■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 IGKV5-2P06315 115 aa26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 SUCLG2Q96I99 432 aa26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 MCCP23508 829 aa26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.54■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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SPHK1-201ENST00000323374 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.53■■□□□ 1.84
SPHK1-201ENST00000323374 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.53■■□□□ 1.84
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