RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299563.4

RNF169-201, Transcript of ring finger protein 169, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF169, Length 7,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169-201ENST00000299563 METTL24Q5JXM2 366 aa20.14■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CEP112Q8N8E3 955 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 PRC1O43663 620 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 NAPBQ9H115 298 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CALML4Q96GE6 196 aa20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SLF2Q8IX21 1173 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CEP135Q66GS9 1140 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CCDC6Q16204 474 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 NDC80O14777 642 aa20.12■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CFAP58Q5T655 872 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 STAC3Q96MF2 364 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SH3BP5O60239 455 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 TBC1D5Q92609 795 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SAMM50Q9Y512 469 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CCDC7Q96M83 1385 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SYCE3A1L190 88 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 C8orf76Q96K31 380 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.11■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CNNM3Q8NE01 707 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 HSF2BPO75031 334 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CTAGE5O15320 804 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CCDC172P0C7W6 258 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CCDC174Q6PII3 467 aa20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CBX1P83916 185 aa20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 BCAR3O75815 825 aa20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 JADE2Q9NQC1 790 aa20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 PDE3AQ14432 1141 aa20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.08■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 BICD1Q96G01 975 aa20.08■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.08■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.08■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 NLRP5P59047 1200 aa20.08■□□□□ 0.81
RNF169-201ENST00000299563 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.08■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.08■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.08■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 HSPA4P34932 840 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 STX6O43752 255 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 SEPT6Q14141 434 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 TMX1Q9H3N1 280 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 ESPNB1AK53 854 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.07■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 KIF4AO95239 1232 aa20.06■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.06■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.06■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 SNX16P57768 344 aa20.06■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CUX1P39880 1505 aa20.06■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 MAP3K12Q12852 859 aa20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CCDC63Q8NA47 563 aa20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 GSDMDP57764 484 aa20.04■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.04■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 MNAT1P51948 309 aa20.04■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 ZBTB16Q05516 673 aa20.04■□□□□ 0.8
RNF169-201ENST00000299563 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms