RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 TRIM5Q9C035 493 aa19.68■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC192P0DO97 292 aa19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 TIGD1Q96MW7 591 aa19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 NME9Q86XW9 330 aa19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 KRT222Q8N1A0 295 aa19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 ATP10DQ9P241 1426 aa19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 REREQ9P2R6 1566 aa19.67■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 IL25Q9H293 177 aa19.66■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 CPA1P15085 419 aa19.66■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.66■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 MLECQ14165 292 aa19.66■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 UNC5CLQ8IV45 518 aa19.66■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 CHMLP26374 656 aa19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 KMT5BQ4FZB7 885 aa19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 POLKQ9UBT6 870 aa19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 SMC3Q9UQE7 1217 aa19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 RTL1A6NKG5 1358 aa19.65■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 F13A1P00488 732 aa19.64■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 MCM10Q7L590 875 aa19.64■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 TMEM87AQ8NBN3 555 aa19.64■□□□□ 0.74
AFG3L2-201ENST00000269143 F6X3S4 739 aa19.64■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19.64■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 RGS12O14924 1447 aa19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 HMMRO75330 724 aa19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM173BQ6P4H8 233 aa19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 CERS3Q8IU89 383 aa19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.63■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 CEP135Q66GS9 1140 aa19.62■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 FERMT3Q86UX7 667 aa19.62■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM200AQ8TCP9 573 aa19.62■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ALKQ9UM73 1620 aa19.62■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF853P0CG23 659 aa19.62■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 AK2P54819 239 aa19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ELF2Q15723 593 aa19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC83Q8IWF9 413 aa19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ANAPC15P60006 121 aa19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ANO6Q4KMQ2 910 aa19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 TYRO3Q06418 890 aa19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 USP27XA6NNY8 438 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 TRIM34Q9BYJ4 488 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ARID5BQ14865 1188 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.6■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 LARGE1O95461 756 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 SLC4A2P04920 1241 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 CAPN2P17655 700 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 LIG1P18858 919 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 CBX8Q9HC52 389 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 GJB2P29033 226 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 MAP3K11Q16584 847 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 GTF3C6Q969F1 213 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.59■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.58■□□□□ 0.73
AFG3L2-201ENST00000269143 OSBPL3Q9H4L5 887 aa19.58■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 RUFY3Q7L099 469 aa19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 LRRCC1Q9C099 1032 aa19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 SYCP1Q15431 976 aa19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.56■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 RASEFQ8IZ41 740 aa19.56■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 TNMDQ9H2S6 317 aa19.56■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa19.56■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.56■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF75DP51815 510 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 ZBTB9Q96C00 473 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 DACT1Q9NYF0 836 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 DNAJC25Q9H1X3 360 aa19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
AFG3L2-201ENST00000269143 DIP2BQ9P265 1576 aa19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms