RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.02■■□□□ 1.28
TTYH3-201ENST00000258796 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.02■■□□□ 1.28
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.02■■□□□ 1.28
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC181Q5TID7 509 aa23.02■■□□□ 1.28
TTYH3-201ENST00000258796 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 FAM177BA6PVY3 158 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 ANAPC15P60006 121 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 C8orf76Q96K31 380 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 STIM1Q13586 685 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 STX1AQ16623 288 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 DEF6Q9H4E7 631 aa23.01■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CAVIN2O95810 425 aa23■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 TMC6Q7Z403 805 aa23■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 FAM200AQ8TCP9 573 aa23■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 EVI5LQ96CN4 794 aa22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 BIN1O00499 593 aa22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 NECAB1Q8N987 351 aa22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 NUP160Q12769 1436 aa22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.99■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 21.3
TTYH3-201ENST00000258796 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 GBP3Q9H0R5 595 aa22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 DCTPP1Q9H773 170 aa22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CASQ1P31415 396 aa22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 RBSNQ9H1K0 784 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CABP4P57796 275 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.97■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 IDI1Q13907 227 aa22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 KIF5CO60282 957 aa22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.96■■□□□ 1.27
TTYH3-201ENST00000258796 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.95■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.95■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.95■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 KRT222Q8N1A0 295 aa22.95■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 VAMP4O75379 141 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 F13A1P00488 732 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 USP26Q9BXU7 913 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 DACT1Q9NYF0 836 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 MYO6Q9UM54 1294 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CENPHQ9H3R5 247 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 SKILP12757 684 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 TSPYL6Q8N831 410 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 WASF1Q92558 559 aa22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 ATF3P18847 181 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 IQCEQ6IPM2 695 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 KIAA1328Q86T90 577 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 TMX1Q9H3N1 280 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 GRIN2AQ12879 1464 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.93■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 PPFIA3O75145 1194 aa22.92■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.92■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.92■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 TDO2P48775 406 aa22.92■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.92■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 USP8P40818 1118 aa22.91■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.91■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 NEK1Q96PY6 1258 aa22.91■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.91■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.9■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.9■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.9■■□□□ 1.26
TTYH3-201ENST00000258796 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms