RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.11■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 GNAI3P08754 354 aa22.1■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 PROSER3Q2NL68 480 aa22.1■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.09■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 PSME1Q06323 249 aa22.09■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 MAP3K5Q99683 1374 aa22.08■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PANX1-201ENST00000227638 ORAI2Q96SN7 254 aa22.08■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.07■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 RASEFQ8IZ41 740 aa22.07■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.06■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.05■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.05■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 NWD1Q149M9 1564 aa22.03■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.03■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.03■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 SSH3Q8TE77 659 aa22.02■■□□□ 1.12
PANX1-201ENST00000227638 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.01■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 BTBD11A6QL63 1104 aa22.01■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 LARGE1O95461 756 aa22■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 ZNF445P59923 1031 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 TEFQ10587 303 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 BEND3Q5T5X7 828 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 BRD1O95696 1058 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 SIL1Q9H173 461 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 STAP2Q9UGK3 403 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 MCCP23508 829 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.99■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 PTH1RQ03431 593 aa21.98■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 IP6K1Q92551 441 aa21.98■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.98■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 SLC39A6Q13433 755 aa21.98■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.98■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.98■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.97■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 AK2P54819 239 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 PTMSP20962 102 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 USP48Q86UV5 1035 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 LTN1O94822 1766 aa21.96■■□□□ 1.11
PANX1-201ENST00000227638 CHGBP05060 677 aa21.95■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 CUL4AQ13619 759 aa21.95■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 HSPA4P34932 840 aa21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 POLA2Q14181 598 aa21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 ADCY9O60503 1353 aa21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 SGSM2O43147 1006 aa21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 RUFY3Q7L099 469 aa21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.94■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 GCP02774 474 aa21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 NECAB1Q8N987 351 aa21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 MYL6BP14649 208 aa21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.92■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 FAM227BQ96M60 508 aa21.92■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.92■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 ZMYND15Q9H091 742 aa21.92■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.92■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.91■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.91■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 FIBPO43427 364 aa21.91■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.9■■□□□ 1.1
PANX1-201ENST00000227638 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms