RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stk32bQ9JJX8 414 aa28.84■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc12a5Q91V14 1138 aa28.83■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp646Q6NV66 1788 aa28.83■■■□□ 2.21
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa28.82■■■□□ 2.2
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf428Q8C1M2 176 aa28.82■■■□□ 2.2
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PalmQ9Z0P4 383 aa28.81■■■□□ 2.2
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Unc5clQ6R653 518 aa28.8■■■□□ 2.2
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col5a2Q3U962 1497 aa28.79■■■□□ 2.2
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PdgfdQ925I7 370 aa28.79■■■□□ 2.2
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Strn4P58404 760 aa28.77■■■□□ 2.2
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adcy9P51830 1353 aa28.76■■■□□ 2.2
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam83gQ5SWY7 812 aa28.75■■■□□ 2.19
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa28.75■■■□□ 2.19
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Micall1Q8BGT6 870 aa28.75■■■□□ 2.19
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdca7Q9D0M2 382 aa28.74■■■□□ 2.19
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ambra1A2AH22 1300 aa28.73■■■□□ 2.19
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snap23O09044 210 aa28.73■■■□□ 2.19
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa28.72■■■□□ 2.19
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa28.71■■■□□ 2.19
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa28.69■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sall2Q9QX96 1004 aa28.69■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MetP16056 1379 aa28.68■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dpf1Q9QX66 387 aa28.68■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp777B9EKF4 885 aa28.66■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 VegfbP49766 207 aa28.66■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlrp6Q91WS2 869 aa28.66■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 P2rx7Q9Z1M0 595 aa28.66■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa28.66■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col26a1Q91VF6 440 aa28.64■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nup188Q6ZQH8 1759 aa28.64■■■□□ 2.18
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col4a1P02463 1669 aa28.64■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc4a9E9PUP3 929 aa28.63■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arid3aQ62431 601 aa28.63■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp48Q3V0C5 1052 aa28.62■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28.61■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trpm7Q923J1 1863 aa28.59■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prr5lA2AVJ5 370 aa28.59■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr247E9PVJ7 320 aa28.58■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr819K7N727 320 aa28.58■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa28.58■■■□□ 2.17
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lama4P97927 1816 aa28.57■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa28.57■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exoc6Q8R313 802 aa28.57■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snai1Q02085 264 aa28.56■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa28.56■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptf1aQ9QX98 324 aa28.56■■■□□ 2.16
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mylk2Q8VCR8 613 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GsdmaQ9EST1 446 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp831A2ADM8 1628 aa28.54■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atf7ipQ7TT18 1306 aa28.53■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm12185Q5NCB2 835 aa28.53■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plagl1Q9JLQ4 704 aa28.53■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q7TT23 1179 aa28.52■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mrc1Q61830 1456 aa28.52■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mical3Q8CJ19 1993 aa28.51■■■□□ 2.16
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlgn2Q69ZK9 836 aa28.51■■■□□ 2.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tsen2Q6P7W5 460 aa28.51■■■□□ 2.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stk31Q99MW1 1018 aa28.51■■■□□ 2.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scn9aQ62205 1984 aa28.51■■■□□ 2.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Esco1Q69Z69 843 aa28.5■■■□□ 2.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Glis2Q8VDL9 521 aa28.5■■■□□ 2.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fstl1Q62356 306 aa28.47■■■□□ 2.15
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcc12Q80WJ6 1366 aa28.47■■■□□ 2.15
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Btbd11Q6GQW0 1109 aa28.42■■■□□ 2.14
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dcdc2bF7BCK0 340 aa28.4■■■□□ 2.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Foxd1Q61345 456 aa28.4■■■□□ 2.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vil1Q62468 827 aa28.4■■■□□ 2.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Csf1rP09581 977 aa28.39■■■□□ 2.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zscan21Q07231 555 aa28.39■■■□□ 2.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rgs19Q9CX84 216 aa28.39■■■□□ 2.14
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa28.38■■■□□ 2.13
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrch1P62046 709 aa28.38■■■□□ 2.13
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dok7Q18PE0 504 aa28.38■■■□□ 2.13
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