RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Casz1Q9CWL2 1761 aa28.17■■■□□ 2.1
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2c69E9PXC3 491 aa28.17■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pibf1E9Q6K3 756 aa28.17■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2c40P56657 491 aa28.17■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dlg5E9Q9R9 1921 aa28.16■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.16■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa28.15■■■□□ 2.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MetP16056 1379 aa28.14■■■□□ 2.1
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Strn4P58404 760 aa28.12■■■□□ 2.09
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa28.12■■■□□ 2.09
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cfap70D3YVL2 1141 aa28.09■■■□□ 2.09
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atf5O70191 283 aa28.09■■■□□ 2.09
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa28.05■■■□□ 2.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28.04■■■□□ 2.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubn2Q80WC1 1314 aa28.04■■■□□ 2.08
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim26Q99PN3 545 aa28.04■■■□□ 2.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kank1E9Q238 1360 aa28.02■■■□□ 2.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa28.02■■■□□ 2.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem119Q8R138 280 aa28.02■■■□□ 2.08
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28.01■■■□□ 2.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6268A2A3U9 297 aa28.01■■■□□ 2.07
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IarsQ8BU30 1262 aa28■■■□□ 2.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr3glQ8R0C0 218 aa28■■■□□ 2.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcl2l13P59017 434 aa27.99■■■□□ 2.07
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf710Q3U288 666 aa27.98■■■□□ 2.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc60Q8C4J0 545 aa27.98■■■□□ 2.07
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itgb4A2A863 1818 aa27.97■■■□□ 2.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 B4galnt4Q766D5 1034 aa27.97■■■□□ 2.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Morc2aQ69ZX6 1030 aa27.96■■■□□ 2.07
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Megf6Q80V70 1572 aa27.92■■■□□ 2.06
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa27.92■■■□□ 2.06
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akap2O54931 893 aa27.91■■■□□ 2.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slf2Q6P9P0 1278 aa27.91■■■□□ 2.06
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klrk1O54709 232 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snai1Q02085 264 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tango6Q8C3S2 1079 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa27.9■■■□□ 2.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam122aQ9DB52 284 aa27.89■■■□□ 2.06
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