RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000043884.5

Lrrn3-201, Transcript of Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrrn3, Length 3,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Mst1rQ62190 1378 aa6.48□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Bicdl1A0JNT9 577 aa6.48□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Nwd2Q6P5U7 1742 aa6.48□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ankrd50F7BE84 1390 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Chpf2Q3UU43 768 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ssfa2Q922B9 1252 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Nsd3Q6P2L6 1439 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ints5Q8CHT3 1018 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Lrit1Q8K099 624 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 TefQ9JLC6 301 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Fer1l6E0CZ42 1862 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Nectin2P32507 530 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Jmjd4Q8BFT6 427 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ak7Q9D2H2 614 aa6.47□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Tns2Q8CGB6 1400 aa6.46□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kcnj4P52189 445 aa6.46□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ripply1Q2WG77 201 aa6.46□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa6.46□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cap2Q9CYT6 476 aa6.46□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Fam114a1Q9D281 569 aa6.46□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Abcc12Q80WJ6 1366 aa6.46□□□□□ -1.37
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Znf330Q922H9 316 aa6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 PigbQ9JJQ0 542 aa6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Trim30aP15533 496 aa6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 CastP51125 788 aa6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 GalcP54818 684 aa6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Aplp1Q03157 653 aa6.46□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Clcn1Q64347 994 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Plekhh1Q80TI1 1356 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Mast2Q60592 1734 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Prr29B1ARI9 187 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ankrd13dQ6PD24 605 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Gys2Q8VCB3 704 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 AceP09470 1312 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Dcaf5Q80T85 946 aa6.45□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kat6bQ8BRB7 1872 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 L3mbtl2P59178 703 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Prkab2Q6PAM0 271 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 GckrQ91X44 587 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Atg3Q9CPX6 314 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rwdd1Q9CQK7 243 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Trpm3Q5F4S9 1721 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Arhgap33Q80YF9 1305 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Flad1Q8R123 492 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Pnpla7A2AJ88 1352 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Lekr1B2RVN1 116 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Miga2Q8BK03 593 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Slc39a6Q8C145 765 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Crb1Q8VHS2 1405 aa6.44□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Vamp4O70480 141 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Tnks1bp1P58871 1720 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Gse1Q3U3C9 1213 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 PsapQ61207 557 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Sv2bQ8BG39 683 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Col1a2Q01149 1372 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Smarcc1P97496 1104 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Pde4dQ01063 747 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Nutm1Q8BHP2 1126 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Taf7Q9R1C0 341 aa6.43□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Adam1bQ8R534 806 aa6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Syde2E9PUP1 1314 aa6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Fam83gQ5SWY7 812 aa6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Pim2Q62070 370 aa6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 GapdhsQ64467 440 aa6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Iqsec3Q3TES0 1195 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Morc2aQ69ZX6 1030 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ssh1Q76I79 1042 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 SympkQ80X82 1284 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Strn4P58404 760 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Vars2Q3U2A8 1060 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Ric3Q8BPM6 367 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Snapc4Q8BP86 1333 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Atf5O70191 283 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Mcm4P49717 862 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Kiaa0753Q6A000 959 aa6.41□□□□□ -1.38
Lrrn3-201ENSMUST00000043884 Erbb3Q61526 1339 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.9 ms