RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Brpf3	B2KF05	1204 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plekhd1	B2RPU2	505 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zc3h12b	G3X9I7	835 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnni2	P13412	182 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jund	P15066	341 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tcea3	P23881	347 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rack1	P68040	317 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Epas1	P97481	874 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hdgfl1	Q2VPR5	283 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atl2	Q6PA06	583 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iqce	Q6PCQ0	778 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Relt	Q8BX43	436 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tshz3	Q8CGV9	1081 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhgb4	Q91XX6	912 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Speer4f1	Q9D5Q6	258 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Polh	Q9JJN0	694 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cog1	Q9Z160	980 aa		5.1	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc146	E9Q9F7	977 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ap1g2	O88512	791 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Calr	P14211	416 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rph3a	P47708	681 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clcn1	Q64347	994 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cand2	Q6ZQ73	1235 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fmr1nb	Q80ZA7	238 aa		5.09	□□□□□ -1.59
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Soga3	Q6NZL0	945 aa		5.09	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Paf1	Q8K2T8	535 aa		5.09	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r199	Q8R280	367 aa		5.09	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rem2	Q8VEL9	341 aa		5.09	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3147	A0A0J9YU88	481 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10424	A0A0J9YVD0	481 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nfxl1	E9Q8I7	918 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm7971	J3QMM8	481 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hsd17b7	O88736	334 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	BC061212	Q6P8K3	481 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bmt2	Q8BXK4	403 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Setdb2	Q8C267	713 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ssuh2	Q8C3L1	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	A430089I19Rik	Q8C9W1	407 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd49	Q8VE42	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf354b	Q9QXT9	601 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Frmpd1	A2AKB4	1549 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zc3h7b	F8VPP8	982 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eln	P54320	860 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8BGN9	141 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc158	Q8CDI6	1109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ubl4b	Q9CQ84	188 aa		5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prpf40a	Q9R1C7	953 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tpx2	A2APB8	745 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttll13	A4Q9F6	804 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rasa1	E9PYG6	1038 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Erich2	E9Q1A6	463 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm20503	G3UZK1	150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r9a	H3BJD6	1292 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hsd3b2	P26149	373 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Top1	Q04750	767 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nfe2	Q07279	373 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ogfod1	Q3U0K8	545 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rccd1	Q8BTU7	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lsm14a	Q8K2F8	462 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sgsm3	Q8VCZ6	750 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lgr5	Q9Z1P4	907 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1700017N19Rik	A0A087WPJ1	469 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dthd1	E9PZX1	795 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ldha	P06151	332 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ldhb	P16125	334 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map4	P27546	1125 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Setd4	P58467	439 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trappc10	Q3TLI0	1259 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm1587	Q3UT80	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prdm1	Q60636	856 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Thrsp	Q62264	150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anks6	Q6GQX6	883 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adamts2	Q8C9W3	1213 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fcrla	Q920A9	352 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9CQ90	155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rmi1	Q9D4G9	616 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Exosc9	Q9JHI7	438 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ak2	Q9WTP6	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3264	L7N2C5	238 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tsks	O54887	585 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col19a1	Q0VF58	1136 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nutm2	Q3V0C3	733 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slfnl1	Q8BHW9	410 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8BP99	230 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppm1m	Q8BU27	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cxxc1	Q9CWW7	660 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Speer4b	Q9D9F7	267 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpc1	Q9QZF2	557 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pex14	Q9R0A0	376 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zcchc6	Q5BLK4	1491 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aldh3a2	P47740	484 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sema3e	P70275	775 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc125	Q5U465	500 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdc37	Q61081	379 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif4g2	Q62448	906 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf507	Q6ZPY5	941 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lpp	Q8BFW7	613 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm5591	Q8CDK1	855 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam161a	Q8QZV6	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zkscan5	Q9Z1D8	819 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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