RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558382.2

AC087477.2-201, humanhuman

TSL 3

Gene AC087477.2, Length 570 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC087477.2-201ENST00000558382 CFAP36Q96G28 342 aa22.11■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.11■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.11■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.11■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ABI3Q9P2A4 366 aa22.11■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 SCTRP47872 440 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PER3P56645 1201 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 DNAJB8Q8NHS0 232 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 M1APQ8TC57 530 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 NT5CQ8TCD5 201 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ANKRD7Q92527 254 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 NEIL2Q969S2 332 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PSAT1Q9Y617 370 aa22.1■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 A0A1B0GUH1 482 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 USP27XA6NNY8 438 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 E7ESA3 106 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 NDUFS4O43181 175 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 OR1F1O43749 312 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PRAMEF2O60811 474 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 UQCRHP07919 91 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 AHRP35869 848 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ITGA8P53708 1063 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 DR1Q01658 176 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ZNF33BQ06732 778 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 EXT1Q16394 746 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ACER2Q5QJU3 275 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 RELTQ969Z4 430 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PEX11GQ96HA9 241 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 NPAS2Q99743 824 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 MMP25Q9NPA2 562 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.09■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 GUCA1CO95843 209 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ALOX12P18054 663 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ARL4CP56559 192 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 ZNF354BQ96LW1 612 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.08■■□□□ 1.13
AC087477.2-201ENST00000558382 TTI1O43156 1089 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 DNAJB6O75190 326 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 RASAL1O95294 804 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CRYABP02511 175 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 FHP07954 510 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 MST1P26927 711 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 KCNK10P57789 538 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 REEP5Q00765 189 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 MGAT5Q09328 741 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CSHL1Q14406 222 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 NSDHLQ15738 373 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 SFT2D3Q587I9 215 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 BEST3Q8N1M1 668 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 TSLPQ969D9 159 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 PELI2Q9HAT8 420 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 ZFATQ9P243 1243 aa22.07■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 A8MUI8 341 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CCDC188H7C350 402 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CHST10O43529 356 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 ZG16O60844 167 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 B3GALT4O96024 378 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 MYBL2P10244 700 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 SKP1P63208 163 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CDKL1Q00532 357 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 RGS1Q08116 209 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 HYAL2Q12891 473 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 DEFB134Q4QY38 66 aa22.06■■□□□ 1.12
AC087477.2-201ENST00000558382 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms