RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GFRALQ6UXV0 394 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNDP1Q96KN2 507 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC25Q96NG3 672 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP3K3Q99759 626 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCLK3Q9C098 648 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB33BQ9H082 229 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSTL1Q9H114 145 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACTR8Q9H981 624 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FANCFQ9NPI8 374 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STUB1Q9UNE7 303 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCAPD2Q15021 1401 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0G2JPF8 293 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHADO15335 359 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAM12O43184 909 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LANCL1O43813 399 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRP3O75074 770 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRAP2O75791 330 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CALCBP10092 127 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THRBP10828 461 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOXB2P14652 356 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GJB2P29033 226 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP8P40818 1118 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFSF10P50591 281 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGGT1BP53609 377 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSTP61278 116 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HERV-K104P63124 156 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRAF3Q13114 568 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHIT1Q13231 466 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STX1AQ16623 288 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF19Q2TAC6 998 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CENPPQ6IPU0 288 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRUNE1Q86TP1 453 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EID3Q8N140 333 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRTM2Q8N967 370 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM71CQ8NEG0 241 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR2T34Q8NGX1 318 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEPT8Q92599 483 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABHD8Q96I13 439 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGED4Q96JG8 741 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GUCD1Q96NT3 240 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VAT1LQ9HCJ6 419 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 YAE1D1Q9NRH1 226 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2orf81A6NN90 581 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS26AO75436 327 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAF1P04049 648 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFTPBP07988 381 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RALAP11233 206 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNSP15586 552 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPHA2P29317 976 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CETN2P41208 172 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDH11P55287 796 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIPK1Q13546 671 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NADK2Q4G0N4 442 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BOLA3Q53S33 107 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms